Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NdnP25233 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NdnP25233 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NdnP25233 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NdnP25233 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NdnP25233 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NdnP25233 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NdnP25233 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NdnP25233 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NdnP25233 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NdnP25233 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NdnP25233 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NdnP25233 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NdnP25233 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NdnP25233 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NdnP25233 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NdnP25233 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NdnP25233 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NdnP25233 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NdnP25233 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NdnP25233 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NdnP25233 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NdnP25233 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NdnP25233 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NdnP25233 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.32■■□□□ 1
NdnP25233 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NdnP25233 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NdnP25233 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NdnP25233 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NdnP25233 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NdnP25233 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NdnP25233 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NdnP25233 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NdnP25233 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NdnP25233 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NdnP25233 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NdnP25233 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NdnP25233 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NdnP25233 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NdnP25233 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NdnP25233 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NdnP25233 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NdnP25233 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NdnP25233 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NdnP25233 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NdnP25233 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NdnP25233 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NdnP25233 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NdnP25233 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NdnP25233 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NdnP25233 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NdnP25233 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NdnP25233 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NdnP25233 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NdnP25233 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NdnP25233 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NdnP25233 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NdnP25233 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NdnP25233 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NdnP25233 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NdnP25233 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NdnP25233 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NdnP25233 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NdnP25233 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NdnP25233 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NdnP25233 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NdnP25233 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NdnP25233 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NdnP25233 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NdnP25233 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NdnP25233 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NdnP25233 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NdnP25233 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NdnP25233 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NdnP25233 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NdnP25233 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NdnP25233 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NdnP25233 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NdnP25233 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NdnP25233 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NdnP25233 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NdnP25233 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NdnP25233 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NdnP25233 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NdnP25233 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NdnP25233 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NdnP25233 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NdnP25233 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NdnP25233 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NdnP25233 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
NdnP25233 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NdnP25233 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NdnP25233 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NdnP25233 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NdnP25233 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NdnP25233 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NdnP25233 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NdnP25233 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NdnP25233 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NdnP25233 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms