Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Clk1P22518 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Clk1P22518 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Clk1P22518 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Clk1P22518 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Clk1P22518 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clk1P22518 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clk1P22518 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clk1P22518 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clk1P22518 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clk1P22518 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clk1P22518 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clk1P22518 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clk1P22518 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clk1P22518 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Clk1P22518 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Clk1P22518 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clk1P22518 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clk1P22518 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clk1P22518 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clk1P22518 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clk1P22518 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clk1P22518 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clk1P22518 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clk1P22518 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clk1P22518 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clk1P22518 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clk1P22518 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clk1P22518 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Clk1P22518 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clk1P22518 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Clk1P22518 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clk1P22518 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clk1P22518 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clk1P22518 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clk1P22518 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clk1P22518 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clk1P22518 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Clk1P22518 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clk1P22518 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clk1P22518 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Clk1P22518 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clk1P22518 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clk1P22518 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clk1P22518 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clk1P22518 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Clk1P22518 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Clk1P22518 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clk1P22518 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clk1P22518 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clk1P22518 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clk1P22518 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Clk1P22518 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Clk1P22518 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Clk1P22518 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Clk1P22518 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Clk1P22518 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clk1P22518 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Clk1P22518 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clk1P22518 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Clk1P22518 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clk1P22518 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clk1P22518 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clk1P22518 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clk1P22518 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clk1P22518 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clk1P22518 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clk1P22518 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clk1P22518 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Clk1P22518 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clk1P22518 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clk1P22518 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Clk1P22518 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clk1P22518 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clk1P22518 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Clk1P22518 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clk1P22518 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clk1P22518 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Clk1P22518 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clk1P22518 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clk1P22518 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clk1P22518 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clk1P22518 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clk1P22518 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clk1P22518 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clk1P22518 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clk1P22518 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clk1P22518 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clk1P22518 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clk1P22518 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clk1P22518 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clk1P22518 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clk1P22518 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clk1P22518 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clk1P22518 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clk1P22518 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clk1P22518 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Clk1P22518 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clk1P22518 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Clk1P22518 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms