Protein–RNA interactions for Protein: P21278

Gna11, Guanine nucleotide-binding protein subunit alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gna11P21278 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31,79■■■□□ 2,68
Gna11P21278 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31,76■■■□□ 2,67
Gna11P21278 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Gna11P21278 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,71■■■□□ 2,67
Gna11P21278 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,68■■■□□ 2,66
Gna11P21278 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,68■■■□□ 2,66
Gna11P21278 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31,67■■■□□ 2,66
Gna11P21278 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Gna11P21278 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,64■■■□□ 2,65
Gna11P21278 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Gna11P21278 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31,63■■■□□ 2,65
Gna11P21278 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Gna11P21278 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,57■■■□□ 2,65
Gna11P21278 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,55■■■□□ 2,64
Gna11P21278 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Gna11P21278 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31,48■■■□□ 2,63
Gna11P21278 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Gna11P21278 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Gna11P21278 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Gna11P21278 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Gna11P21278 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Gna11P21278 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,33■■■□□ 2,61
Gna11P21278 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,32■■■□□ 2,6
Gna11P21278 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31,29■■■□□ 2,6
Gna11P21278 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31,28■■■□□ 2,6
Gna11P21278 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Gna11P21278 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Gna11P21278 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Gna11P21278 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,22■■■□□ 2,59
Gna11P21278 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,2■■■□□ 2,58
Gna11P21278 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31,17■■■□□ 2,58
Gna11P21278 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,16■■■□□ 2,58
Gna11P21278 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31,1■■■□□ 2,57
Gna11P21278 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31,09■■■□□ 2,57
Gna11P21278 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31,07■■■□□ 2,56
Gna11P21278 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Gna11P21278 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31,04■■■□□ 2,56
Gna11P21278 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,01■■■□□ 2,55
Gna11P21278 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30,97■■■□□ 2,55
Gna11P21278 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30,96■■■□□ 2,55
Gna11P21278 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Gna11P21278 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Gna11P21278 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Gna11P21278 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Gna11P21278 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Gna11P21278 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30,89■■■□□ 2,54
Gna11P21278 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,87■■■□□ 2,53
Gna11P21278 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Gna11P21278 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,85■■■□□ 2,53
Gna11P21278 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30,85■■■□□ 2,53
Gna11P21278 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30,84■■■□□ 2,53
Gna11P21278 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,82■■■□□ 2,52
Gna11P21278 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Gna11P21278 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30,81■■■□□ 2,52
Gna11P21278 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,78■■■□□ 2,52
Gna11P21278 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Gna11P21278 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Gna11P21278 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30,75■■■□□ 2,51
Gna11P21278 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Gna11P21278 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Gna11P21278 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,74■■■□□ 2,51
Gna11P21278 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Gna11P21278 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Gna11P21278 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Gna11P21278 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Gna11P21278 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Gna11P21278 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Gna11P21278 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Gna11P21278 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Gna11P21278 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Gna11P21278 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Gna11P21278 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Gna11P21278 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30,5■■■□□ 2,47
Gna11P21278 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Gna11P21278 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Gna11P21278 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,45■■■□□ 2,46
Gna11P21278 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Gna11P21278 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Gna11P21278 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Gna11P21278 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30,39■■■□□ 2,46
Gna11P21278 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Gna11P21278 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Gna11P21278 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Gna11P21278 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Gna11P21278 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Gna11P21278 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Gna11P21278 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Gna11P21278 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,2■■■□□ 2,43
Gna11P21278 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Gna11P21278 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Gna11P21278 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Gna11P21278 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Gna11P21278 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Gna11P21278 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Gna11P21278 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Gna11P21278 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Gna11P21278 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Gna11P21278 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Gna11P21278 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Gna11P21278 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms