Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,21■■■□□ 2,27
Klra1P20937 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Klra1P20937 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Klra1P20937 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Klra1P20937 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Klra1P20937 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Klra1P20937 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Klra1P20937 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Klra1P20937 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Klra1P20937 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,09■■■□□ 2,25
Klra1P20937 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Klra1P20937 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Klra1P20937 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Klra1P20937 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
Klra1P20937 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Klra1P20937 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Klra1P20937 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Klra1P20937 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Klra1P20937 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Klra1P20937 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Klra1P20937 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,75■■■□□ 2,19
Klra1P20937 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Klra1P20937 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,73■■■□□ 2,19
Klra1P20937 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Klra1P20937 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Klra1P20937 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Klra1P20937 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Klra1P20937 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Klra1P20937 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Klra1P20937 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,64■■■□□ 2,17
Klra1P20937 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Klra1P20937 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Klra1P20937 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,59■■■□□ 2,17
Klra1P20937 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,59■■■□□ 2,17
Klra1P20937 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Klra1P20937 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Klra1P20937 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Klra1P20937 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Klra1P20937 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Klra1P20937 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28,48■■■□□ 2,15
Klra1P20937 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Klra1P20937 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Klra1P20937 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Klra1P20937 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,42■■■□□ 2,14
Klra1P20937 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Klra1P20937 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Klra1P20937 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Klra1P20937 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Klra1P20937 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Klra1P20937 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Klra1P20937 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Klra1P20937 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Klra1P20937 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Klra1P20937 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Klra1P20937 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28,26■■■□□ 2,11
Klra1P20937 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Klra1P20937 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Klra1P20937 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Klra1P20937 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,2■■■□□ 2,1
Klra1P20937 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Klra1P20937 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Klra1P20937 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Klra1P20937 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Klra1P20937 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Klra1P20937 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Klra1P20937 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Klra1P20937 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Klra1P20937 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Klra1P20937 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Klra1P20937 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Klra1P20937 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Klra1P20937 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Klra1P20937 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Klra1P20937 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,12■■■□□ 2,09
Klra1P20937 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Klra1P20937 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Klra1P20937 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Klra1P20937 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Klra1P20937 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Klra1P20937 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Klra1P20937 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Klra1P20937 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Klra1P20937 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Klra1P20937 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Klra1P20937 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,97■■■□□ 2,07
Klra1P20937 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Klra1P20937 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Klra1P20937 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Klra1P20937 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,92■■■□□ 2,06
Klra1P20937 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Klra1P20937 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Klra1P20937 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Klra1P20937 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Klra1P20937 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Klra1P20937 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Klra1P20937 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Klra1P20937 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Klra1P20937 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Klra1P20937 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
Klra1P20937 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,6 ms