Protein–RNA interactions for Protein: P20782

Chrne, Acetylcholine receptor subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrneP20782 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ChrneP20782 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ChrneP20782 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ChrneP20782 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ChrneP20782 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ChrneP20782 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ChrneP20782 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ChrneP20782 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ChrneP20782 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ChrneP20782 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ChrneP20782 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ChrneP20782 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ChrneP20782 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ChrneP20782 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ChrneP20782 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ChrneP20782 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ChrneP20782 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ChrneP20782 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ChrneP20782 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ChrneP20782 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ChrneP20782 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ChrneP20782 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ChrneP20782 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ChrneP20782 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ChrneP20782 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ChrneP20782 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ChrneP20782 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ChrneP20782 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ChrneP20782 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ChrneP20782 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ChrneP20782 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ChrneP20782 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ChrneP20782 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ChrneP20782 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ChrneP20782 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ChrneP20782 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ChrneP20782 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ChrneP20782 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ChrneP20782 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ChrneP20782 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ChrneP20782 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ChrneP20782 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ChrneP20782 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ChrneP20782 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ChrneP20782 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ChrneP20782 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ChrneP20782 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ChrneP20782 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ChrneP20782 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ChrneP20782 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ChrneP20782 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ChrneP20782 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ChrneP20782 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ChrneP20782 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ChrneP20782 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ChrneP20782 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ChrneP20782 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ChrneP20782 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ChrneP20782 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ChrneP20782 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ChrneP20782 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ChrneP20782 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ChrneP20782 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ChrneP20782 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ChrneP20782 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChrneP20782 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChrneP20782 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ChrneP20782 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ChrneP20782 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ChrneP20782 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ChrneP20782 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ChrneP20782 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ChrneP20782 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ChrneP20782 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ChrneP20782 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ChrneP20782 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ChrneP20782 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ChrneP20782 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ChrneP20782 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ChrneP20782 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ChrneP20782 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ChrneP20782 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChrneP20782 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ChrneP20782 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ChrneP20782 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ChrneP20782 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ChrneP20782 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChrneP20782 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ChrneP20782 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ChrneP20782 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ChrneP20782 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ChrneP20782 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ChrneP20782 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChrneP20782 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ChrneP20782 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ChrneP20782 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ChrneP20782 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChrneP20782 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ChrneP20782 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ChrneP20782 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms