Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PdgfaP20033 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PdgfaP20033 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PdgfaP20033 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PdgfaP20033 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PdgfaP20033 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PdgfaP20033 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PdgfaP20033 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PdgfaP20033 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PdgfaP20033 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PdgfaP20033 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PdgfaP20033 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PdgfaP20033 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PdgfaP20033 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PdgfaP20033 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PdgfaP20033 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PdgfaP20033 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PdgfaP20033 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PdgfaP20033 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PdgfaP20033 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PdgfaP20033 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PdgfaP20033 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PdgfaP20033 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PdgfaP20033 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PdgfaP20033 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PdgfaP20033 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PdgfaP20033 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PdgfaP20033 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PdgfaP20033 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PdgfaP20033 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PdgfaP20033 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PdgfaP20033 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PdgfaP20033 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PdgfaP20033 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PdgfaP20033 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PdgfaP20033 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PdgfaP20033 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PdgfaP20033 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PdgfaP20033 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PdgfaP20033 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PdgfaP20033 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PdgfaP20033 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PdgfaP20033 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PdgfaP20033 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PdgfaP20033 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PdgfaP20033 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PdgfaP20033 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PdgfaP20033 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PdgfaP20033 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PdgfaP20033 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PdgfaP20033 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PdgfaP20033 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PdgfaP20033 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PdgfaP20033 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PdgfaP20033 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PdgfaP20033 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PdgfaP20033 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PdgfaP20033 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PdgfaP20033 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PdgfaP20033 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PdgfaP20033 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PdgfaP20033 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PdgfaP20033 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PdgfaP20033 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PdgfaP20033 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PdgfaP20033 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PdgfaP20033 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PdgfaP20033 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PdgfaP20033 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PdgfaP20033 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PdgfaP20033 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PdgfaP20033 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PdgfaP20033 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PdgfaP20033 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PdgfaP20033 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PdgfaP20033 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PdgfaP20033 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PdgfaP20033 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PdgfaP20033 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PdgfaP20033 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PdgfaP20033 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PdgfaP20033 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PdgfaP20033 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PdgfaP20033 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PdgfaP20033 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PdgfaP20033 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PdgfaP20033 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PdgfaP20033 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PdgfaP20033 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PdgfaP20033 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PdgfaP20033 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PdgfaP20033 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PdgfaP20033 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PdgfaP20033 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PdgfaP20033 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PdgfaP20033 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PdgfaP20033 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PdgfaP20033 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PdgfaP20033 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PdgfaP20033 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms