Protein–RNA interactions for Protein: P18337

Sell, L-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SellP18337 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
SellP18337 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
SellP18337 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
SellP18337 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,42■■□□□ 1,34
SellP18337 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
SellP18337 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
SellP18337 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
SellP18337 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23,36■■□□□ 1,33
SellP18337 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
SellP18337 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,35■■□□□ 1,33
SellP18337 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23,33■■□□□ 1,33
SellP18337 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
SellP18337 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,31■■□□□ 1,32
SellP18337 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23,3■■□□□ 1,32
SellP18337 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23,28■■□□□ 1,32
SellP18337 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
SellP18337 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23,26■■□□□ 1,31
SellP18337 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
SellP18337 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
SellP18337 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
SellP18337 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
SellP18337 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
SellP18337 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,17■■□□□ 1,3
SellP18337 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
SellP18337 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
SellP18337 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
SellP18337 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23,1■■□□□ 1,29
SellP18337 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
SellP18337 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23,05■■□□□ 1,28
SellP18337 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
SellP18337 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
SellP18337 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
SellP18337 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
SellP18337 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
SellP18337 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22,96■■□□□ 1,27
SellP18337 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22,94■■□□□ 1,26
SellP18337 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22,94■■□□□ 1,26
SellP18337 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22,92■■□□□ 1,26
SellP18337 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
SellP18337 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,9■■□□□ 1,26
SellP18337 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
SellP18337 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
SellP18337 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22,84■■□□□ 1,25
SellP18337 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
SellP18337 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,24
SellP18337 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
SellP18337 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
SellP18337 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
SellP18337 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22,8■■□□□ 1,24
SellP18337 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,79■■□□□ 1,24
SellP18337 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
SellP18337 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
SellP18337 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
SellP18337 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22,74■■□□□ 1,23
SellP18337 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,74■■□□□ 1,23
SellP18337 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
SellP18337 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22,71■■□□□ 1,23
SellP18337 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
SellP18337 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
SellP18337 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
SellP18337 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
SellP18337 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
SellP18337 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
SellP18337 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,61■■□□□ 1,21
SellP18337 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
SellP18337 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22,58■■□□□ 1,21
SellP18337 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22,57■■□□□ 1,2
SellP18337 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
SellP18337 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,55■■□□□ 1,2
SellP18337 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,54■■□□□ 1,2
SellP18337 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
SellP18337 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,51■■□□□ 1,19
SellP18337 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
SellP18337 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,5■■□□□ 1,19
SellP18337 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22,5■■□□□ 1,19
SellP18337 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
SellP18337 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
SellP18337 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22,41■■□□□ 1,18
SellP18337 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
SellP18337 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
SellP18337 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22,37■■□□□ 1,17
SellP18337 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
SellP18337 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22,35■■□□□ 1,17
SellP18337 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
SellP18337 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
SellP18337 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22,32■■□□□ 1,16
SellP18337 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,3■■□□□ 1,16
SellP18337 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22,29■■□□□ 1,16
SellP18337 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
SellP18337 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
SellP18337 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
SellP18337 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22,28■■□□□ 1,16
SellP18337 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22,28■■□□□ 1,16
SellP18337 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,15
SellP18337 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,15
SellP18337 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
SellP18337 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
SellP18337 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22,24■■□□□ 1,15
SellP18337 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
SellP18337 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms