Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,6■□□□□ 0,73
Gata1P17679 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19,59■□□□□ 0,73
Gata1P17679 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Gata1P17679 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,59■□□□□ 0,73
Gata1P17679 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19,57■□□□□ 0,72
Gata1P17679 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,55■□□□□ 0,72
Gata1P17679 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,53■□□□□ 0,72
Gata1P17679 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19,48■□□□□ 0,71
Gata1P17679 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,47■□□□□ 0,71
Gata1P17679 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19,46■□□□□ 0,71
Gata1P17679 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Gata1P17679 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19,4■□□□□ 0,7
Gata1P17679 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,4■□□□□ 0,7
Gata1P17679 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,39■□□□□ 0,7
Gata1P17679 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,37■□□□□ 0,69
Gata1P17679 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19,36■□□□□ 0,69
Gata1P17679 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,34■□□□□ 0,69
Gata1P17679 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19,33■□□□□ 0,68
Gata1P17679 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19,32■□□□□ 0,68
Gata1P17679 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,31■□□□□ 0,68
Gata1P17679 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,31■□□□□ 0,68
Gata1P17679 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19,31■□□□□ 0,68
Gata1P17679 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,31■□□□□ 0,68
Gata1P17679 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
Gata1P17679 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC19,25■□□□□ 0,67
Gata1P17679 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,25■□□□□ 0,67
Gata1P17679 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
Gata1P17679 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC19,2■□□□□ 0,66
Gata1P17679 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
Gata1P17679 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,16■□□□□ 0,66
Gata1P17679 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,15■□□□□ 0,66
Gata1P17679 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,15■□□□□ 0,66
Gata1P17679 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
Gata1P17679 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,12■□□□□ 0,65
Gata1P17679 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19,11■□□□□ 0,65
Gata1P17679 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19,11■□□□□ 0,65
Gata1P17679 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19,11■□□□□ 0,65
Gata1P17679 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,1■□□□□ 0,65
Gata1P17679 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,1■□□□□ 0,65
Gata1P17679 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19,1■□□□□ 0,65
Gata1P17679 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19,1■□□□□ 0,65
Gata1P17679 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,08■□□□□ 0,64
Gata1P17679 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
Gata1P17679 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Gata1P17679 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,05■□□□□ 0,64
Gata1P17679 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19,04■□□□□ 0,64
Gata1P17679 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC19,04■□□□□ 0,64
Gata1P17679 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
Gata1P17679 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0,63
Gata1P17679 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,95■□□□□ 0,62
Gata1P17679 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
Gata1P17679 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,94■□□□□ 0,62
Gata1P17679 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,93■□□□□ 0,62
Gata1P17679 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,91■□□□□ 0,62
Gata1P17679 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
Gata1P17679 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
Gata1P17679 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,61
Gata1P17679 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18,88■□□□□ 0,61
Gata1P17679 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Gata1P17679 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Gata1P17679 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,86■□□□□ 0,61
Gata1P17679 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,85■□□□□ 0,61
Gata1P17679 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18,85■□□□□ 0,61
Gata1P17679 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18,85■□□□□ 0,61
Gata1P17679 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,85■□□□□ 0,61
Gata1P17679 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18,84■□□□□ 0,61
Gata1P17679 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,61
Gata1P17679 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,6
Gata1P17679 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18,83■□□□□ 0,6
Gata1P17679 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18,81■□□□□ 0,6
Gata1P17679 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
Gata1P17679 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18,8■□□□□ 0,6
Gata1P17679 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18,79■□□□□ 0,6
Gata1P17679 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18,79■□□□□ 0,6
Gata1P17679 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18,78■□□□□ 0,6
Gata1P17679 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,77■□□□□ 0,6
Gata1P17679 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18,75■□□□□ 0,59
Gata1P17679 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Gata1P17679 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18,73■□□□□ 0,59
Gata1P17679 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC18,72■□□□□ 0,59
Gata1P17679 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18,72■□□□□ 0,59
Gata1P17679 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,72■□□□□ 0,59
Gata1P17679 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18,71■□□□□ 0,59
Gata1P17679 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
Gata1P17679 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
Gata1P17679 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,7■□□□□ 0,58
Gata1P17679 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,68■□□□□ 0,58
Gata1P17679 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18,67■□□□□ 0,58
Gata1P17679 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18,67■□□□□ 0,58
Gata1P17679 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
Gata1P17679 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Gata1P17679 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Gata1P17679 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Gata1P17679 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,65■□□□□ 0,58
Gata1P17679 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,64■□□□□ 0,57
Gata1P17679 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,61■□□□□ 0,57
Gata1P17679 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18,59■□□□□ 0,57
Gata1P17679 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18,58■□□□□ 0,56
Gata1P17679 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,58■□□□□ 0,56
Gata1P17679 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,57■□□□□ 0,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16,8 ms