Protein–RNA interactions for Protein: P16951

Atf2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf2P16951 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Atf2P16951 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atf2P16951 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atf2P16951 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atf2P16951 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atf2P16951 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atf2P16951 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atf2P16951 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atf2P16951 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atf2P16951 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atf2P16951 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atf2P16951 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atf2P16951 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atf2P16951 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atf2P16951 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Atf2P16951 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atf2P16951 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atf2P16951 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atf2P16951 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Atf2P16951 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Atf2P16951 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atf2P16951 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atf2P16951 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atf2P16951 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Atf2P16951 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atf2P16951 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atf2P16951 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Atf2P16951 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atf2P16951 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atf2P16951 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atf2P16951 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atf2P16951 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atf2P16951 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atf2P16951 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atf2P16951 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atf2P16951 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atf2P16951 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atf2P16951 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atf2P16951 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Atf2P16951 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Atf2P16951 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf2P16951 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf2P16951 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf2P16951 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf2P16951 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Atf2P16951 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Atf2P16951 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Atf2P16951 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Atf2P16951 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Atf2P16951 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atf2P16951 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atf2P16951 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Atf2P16951 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atf2P16951 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atf2P16951 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atf2P16951 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Atf2P16951 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atf2P16951 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Atf2P16951 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atf2P16951 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Atf2P16951 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atf2P16951 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atf2P16951 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf2P16951 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf2P16951 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf2P16951 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atf2P16951 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atf2P16951 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atf2P16951 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atf2P16951 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atf2P16951 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Atf2P16951 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atf2P16951 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atf2P16951 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atf2P16951 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atf2P16951 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atf2P16951 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Atf2P16951 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atf2P16951 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Atf2P16951 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atf2P16951 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Atf2P16951 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Atf2P16951 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Atf2P16951 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atf2P16951 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf2P16951 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf2P16951 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf2P16951 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf2P16951 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf2P16951 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atf2P16951 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atf2P16951 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atf2P16951 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atf2P16951 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf2P16951 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf2P16951 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf2P16951 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf2P16951 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf2P16951 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atf2P16951 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms