Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prf1P10820 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prf1P10820 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prf1P10820 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prf1P10820 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prf1P10820 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prf1P10820 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prf1P10820 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Prf1P10820 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Prf1P10820 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Prf1P10820 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Prf1P10820 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Prf1P10820 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Prf1P10820 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Prf1P10820 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prf1P10820 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Prf1P10820 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Prf1P10820 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prf1P10820 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prf1P10820 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Prf1P10820 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Prf1P10820 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Prf1P10820 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Prf1P10820 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Prf1P10820 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prf1P10820 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Prf1P10820 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Prf1P10820 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prf1P10820 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Prf1P10820 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Prf1P10820 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Prf1P10820 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Prf1P10820 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Prf1P10820 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Prf1P10820 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Prf1P10820 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Prf1P10820 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Prf1P10820 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Prf1P10820 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Prf1P10820 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Prf1P10820 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Prf1P10820 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Prf1P10820 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Prf1P10820 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prf1P10820 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prf1P10820 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prf1P10820 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prf1P10820 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prf1P10820 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Prf1P10820 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prf1P10820 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prf1P10820 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Prf1P10820 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Prf1P10820 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prf1P10820 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prf1P10820 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Prf1P10820 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Prf1P10820 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Prf1P10820 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Prf1P10820 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Prf1P10820 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prf1P10820 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prf1P10820 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Prf1P10820 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Prf1P10820 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prf1P10820 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prf1P10820 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prf1P10820 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Prf1P10820 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Prf1P10820 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Prf1P10820 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Prf1P10820 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Prf1P10820 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Prf1P10820 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prf1P10820 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Prf1P10820 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prf1P10820 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Prf1P10820 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prf1P10820 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Prf1P10820 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Prf1P10820 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Prf1P10820 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Prf1P10820 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prf1P10820 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Prf1P10820 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Prf1P10820 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Prf1P10820 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Prf1P10820 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prf1P10820 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prf1P10820 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Prf1P10820 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prf1P10820 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Prf1P10820 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prf1P10820 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Prf1P10820 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prf1P10820 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Prf1P10820 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Prf1P10820 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Prf1P10820 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Prf1P10820 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms