Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb1P0DN34 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb1P0DN34 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb1P0DN34 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndufb1P0DN34 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ndufb1P0DN34 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndufb1P0DN34 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ndufb1P0DN34 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ndufb1P0DN34 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb1P0DN34 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ndufb1P0DN34 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb1P0DN34 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ndufb1P0DN34 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb1P0DN34 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb1P0DN34 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ndufb1P0DN34 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb1P0DN34 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ndufb1P0DN34 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb1P0DN34 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ndufb1P0DN34 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufb1P0DN34 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufb1P0DN34 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ndufb1P0DN34 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb1P0DN34 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ndufb1P0DN34 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ndufb1P0DN34 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb1P0DN34 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ndufb1P0DN34 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufb1P0DN34 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb1P0DN34 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb1P0DN34 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb1P0DN34 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb1P0DN34 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb1P0DN34 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb1P0DN34 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufb1P0DN34 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufb1P0DN34 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufb1P0DN34 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufb1P0DN34 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufb1P0DN34 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ndufb1P0DN34 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb1P0DN34 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ndufb1P0DN34 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb1P0DN34 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ndufb1P0DN34 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb1P0DN34 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ndufb1P0DN34 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb1P0DN34 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ndufb1P0DN34 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb1P0DN34 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ndufb1P0DN34 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ndufb1P0DN34 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ndufb1P0DN34 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndufb1P0DN34 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufb1P0DN34 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndufb1P0DN34 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb1P0DN34 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndufb1P0DN34 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb1P0DN34 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndufb1P0DN34 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndufb1P0DN34 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufb1P0DN34 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb1P0DN34 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ndufb1P0DN34 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ndufb1P0DN34 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb1P0DN34 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ndufb1P0DN34 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ndufb1P0DN34 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb1P0DN34 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb1P0DN34 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb1P0DN34 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb1P0DN34 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb1P0DN34 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb1P0DN34 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb1P0DN34 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb1P0DN34 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb1P0DN34 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb1P0DN34 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb1P0DN34 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ndufb1P0DN34 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb1P0DN34 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb1P0DN34 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufb1P0DN34 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb1P0DN34 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb1P0DN34 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb1P0DN34 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb1P0DN34 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb1P0DN34 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb1P0DN34 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb1P0DN34 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb1P0DN34 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufb1P0DN34 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ndufb1P0DN34 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndufb1P0DN34 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ndufb1P0DN34 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ndufb1P0DN34 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndufb1P0DN34 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ndufb1P0DN34 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndufb1P0DN34 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ndufb1P0DN34 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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