Protein–RNA interactions for Protein: P09240

Cck, Cholecystokinin, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckP09240 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,72■□□□□ 0,59
CckP09240 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
CckP09240 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18,7■□□□□ 0,58
CckP09240 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18,7■□□□□ 0,58
CckP09240 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18,69■□□□□ 0,58
CckP09240 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,68■□□□□ 0,58
CckP09240 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
CckP09240 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,64■□□□□ 0,57
CckP09240 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,64■□□□□ 0,57
CckP09240 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,63■□□□□ 0,57
CckP09240 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC18,6■□□□□ 0,57
CckP09240 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18,59■□□□□ 0,57
CckP09240 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,58■□□□□ 0,57
CckP09240 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,58■□□□□ 0,56
CckP09240 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,57■□□□□ 0,56
CckP09240 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18,56■□□□□ 0,56
CckP09240 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,55■□□□□ 0,56
CckP09240 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,54■□□□□ 0,56
CckP09240 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,51■□□□□ 0,55
CckP09240 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,47■□□□□ 0,55
CckP09240 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,42■□□□□ 0,54
CckP09240 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,39■□□□□ 0,53
CckP09240 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,38■□□□□ 0,53
CckP09240 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18,35■□□□□ 0,53
CckP09240 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,35■□□□□ 0,53
CckP09240 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,34■□□□□ 0,53
CckP09240 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18,34■□□□□ 0,53
CckP09240 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,33■□□□□ 0,53
CckP09240 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
CckP09240 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,31■□□□□ 0,52
CckP09240 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,29■□□□□ 0,52
CckP09240 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,29■□□□□ 0,52
CckP09240 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,29■□□□□ 0,52
CckP09240 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,29■□□□□ 0,52
CckP09240 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC18,27■□□□□ 0,52
CckP09240 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,27■□□□□ 0,52
CckP09240 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,26■□□□□ 0,51
CckP09240 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18,25■□□□□ 0,51
CckP09240 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,25■□□□□ 0,51
CckP09240 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,24■□□□□ 0,51
CckP09240 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
CckP09240 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18,21■□□□□ 0,51
CckP09240 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
CckP09240 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,5
CckP09240 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
CckP09240 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
CckP09240 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
CckP09240 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
CckP09240 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
CckP09240 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
CckP09240 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
CckP09240 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
CckP09240 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
CckP09240 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
CckP09240 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
CckP09240 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
CckP09240 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,12■□□□□ 0,49
CckP09240 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,12■□□□□ 0,49
CckP09240 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,12■□□□□ 0,49
CckP09240 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18,11■□□□□ 0,49
CckP09240 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
CckP09240 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
CckP09240 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,49
CckP09240 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18,08■□□□□ 0,49
CckP09240 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
CckP09240 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
CckP09240 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18,05■□□□□ 0,48
CckP09240 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
CckP09240 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
CckP09240 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
CckP09240 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
CckP09240 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18,03■□□□□ 0,48
CckP09240 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
CckP09240 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
CckP09240 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
CckP09240 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17,98■□□□□ 0,47
CckP09240 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17,97■□□□□ 0,47
CckP09240 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17,97■□□□□ 0,47
CckP09240 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
CckP09240 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
CckP09240 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,95■□□□□ 0,46
CckP09240 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,93■□□□□ 0,46
CckP09240 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,93■□□□□ 0,46
CckP09240 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17,93■□□□□ 0,46
CckP09240 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,92■□□□□ 0,46
CckP09240 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
CckP09240 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
CckP09240 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
CckP09240 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
CckP09240 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
CckP09240 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
CckP09240 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
CckP09240 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
CckP09240 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17,88■□□□□ 0,45
CckP09240 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
CckP09240 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,86■□□□□ 0,45
CckP09240 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,85■□□□□ 0,45
CckP09240 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
CckP09240 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,84■□□□□ 0,45
CckP09240 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17,83■□□□□ 0,45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms