Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,18■■■□□ 2,1
Hoxb3P09026 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Hoxb3P09026 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Hoxb3P09026 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Hoxb3P09026 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Hoxb3P09026 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Hoxb3P09026 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Hoxb3P09026 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Hoxb3P09026 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
Hoxb3P09026 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28,06■■■□□ 2,08
Hoxb3P09026 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Hoxb3P09026 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,01■■■□□ 2,07
Hoxb3P09026 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Hoxb3P09026 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Hoxb3P09026 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,96■■■□□ 2,07
Hoxb3P09026 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Hoxb3P09026 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,95■■■□□ 2,06
Hoxb3P09026 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Hoxb3P09026 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Hoxb3P09026 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Hoxb3P09026 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Hoxb3P09026 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Hoxb3P09026 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Hoxb3P09026 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Hoxb3P09026 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Hoxb3P09026 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Hoxb3P09026 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Hoxb3P09026 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Hoxb3P09026 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Hoxb3P09026 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Hoxb3P09026 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Hoxb3P09026 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Hoxb3P09026 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Hoxb3P09026 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Hoxb3P09026 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Hoxb3P09026 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Hoxb3P09026 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Hoxb3P09026 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Hoxb3P09026 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Hoxb3P09026 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27,58■■■□□ 2,01
Hoxb3P09026 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Hoxb3P09026 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Hoxb3P09026 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Hoxb3P09026 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,43■■□□□ 1,98
Hoxb3P09026 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Hoxb3P09026 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Hoxb3P09026 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Hoxb3P09026 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Hoxb3P09026 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Hoxb3P09026 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Hoxb3P09026 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Hoxb3P09026 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Hoxb3P09026 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Hoxb3P09026 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Hoxb3P09026 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Hoxb3P09026 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Hoxb3P09026 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Hoxb3P09026 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Hoxb3P09026 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Hoxb3P09026 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Hoxb3P09026 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Hoxb3P09026 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Hoxb3P09026 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Hoxb3P09026 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Hoxb3P09026 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Hoxb3P09026 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Hoxb3P09026 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Hoxb3P09026 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Hoxb3P09026 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Hoxb3P09026 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Hoxb3P09026 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Hoxb3P09026 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Hoxb3P09026 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Hoxb3P09026 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Hoxb3P09026 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Hoxb3P09026 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Hoxb3P09026 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Hoxb3P09026 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Hoxb3P09026 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Hoxb3P09026 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Hoxb3P09026 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,88■■□□□ 1,89
Hoxb3P09026 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26,87■■□□□ 1,89
Hoxb3P09026 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Hoxb3P09026 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Hoxb3P09026 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Hoxb3P09026 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Hoxb3P09026 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Hoxb3P09026 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Hoxb3P09026 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Hoxb3P09026 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Hoxb3P09026 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Hoxb3P09026 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Hoxb3P09026 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Hoxb3P09026 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,78■■□□□ 1,88
Hoxb3P09026 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,77■■□□□ 1,88
Hoxb3P09026 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Hoxb3P09026 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Hoxb3P09026 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Hoxb3P09026 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Hoxb3P09026 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,2 ms