Protein–RNA interactions for Protein: P08883

Gzmf, Granzyme F, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmfP08883 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GzmfP08883 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GzmfP08883 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GzmfP08883 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GzmfP08883 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GzmfP08883 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GzmfP08883 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GzmfP08883 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GzmfP08883 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GzmfP08883 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GzmfP08883 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GzmfP08883 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GzmfP08883 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GzmfP08883 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GzmfP08883 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GzmfP08883 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GzmfP08883 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GzmfP08883 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GzmfP08883 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GzmfP08883 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GzmfP08883 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GzmfP08883 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GzmfP08883 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GzmfP08883 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GzmfP08883 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GzmfP08883 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GzmfP08883 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GzmfP08883 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GzmfP08883 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GzmfP08883 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GzmfP08883 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GzmfP08883 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GzmfP08883 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GzmfP08883 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GzmfP08883 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GzmfP08883 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GzmfP08883 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GzmfP08883 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GzmfP08883 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GzmfP08883 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GzmfP08883 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GzmfP08883 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GzmfP08883 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GzmfP08883 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GzmfP08883 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GzmfP08883 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GzmfP08883 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GzmfP08883 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GzmfP08883 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GzmfP08883 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GzmfP08883 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GzmfP08883 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GzmfP08883 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GzmfP08883 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GzmfP08883 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GzmfP08883 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GzmfP08883 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GzmfP08883 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GzmfP08883 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GzmfP08883 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GzmfP08883 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GzmfP08883 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GzmfP08883 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GzmfP08883 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GzmfP08883 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GzmfP08883 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GzmfP08883 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GzmfP08883 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GzmfP08883 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GzmfP08883 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GzmfP08883 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GzmfP08883 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GzmfP08883 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GzmfP08883 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GzmfP08883 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GzmfP08883 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GzmfP08883 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GzmfP08883 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GzmfP08883 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GzmfP08883 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GzmfP08883 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GzmfP08883 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GzmfP08883 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GzmfP08883 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GzmfP08883 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GzmfP08883 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GzmfP08883 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GzmfP08883 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GzmfP08883 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GzmfP08883 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GzmfP08883 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GzmfP08883 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GzmfP08883 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
GzmfP08883 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GzmfP08883 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GzmfP08883 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
GzmfP08883 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GzmfP08883 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
GzmfP08883 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GzmfP08883 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms