Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
P06336 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
P06336 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
P06336 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
P06336 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
P06336 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
P06336 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
P06336 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
P06336 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
P06336 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
P06336 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
P06336 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
P06336 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
P06336 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
P06336 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
P06336 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
P06336 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
P06336 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
P06336 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
P06336 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
P06336 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
P06336 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
P06336 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
P06336 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
P06336 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P06336 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P06336 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P06336 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P06336 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
P06336 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
P06336 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
P06336 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
P06336 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
P06336 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
P06336 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
P06336 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
P06336 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
P06336 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P06336 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
P06336 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
P06336 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
P06336 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
P06336 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
P06336 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
P06336 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P06336 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
P06336 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
P06336 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P06336 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
P06336 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
P06336 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
P06336 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
P06336 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
P06336 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
P06336 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
P06336 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P06336 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
P06336 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
P06336 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
P06336 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
P06336 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
P06336 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P06336 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
P06336 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
P06336 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
P06336 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P06336 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P06336 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P06336 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
P06336 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P06336 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
P06336 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P06336 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
P06336 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
P06336 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
P06336 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
P06336 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P06336 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P06336 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
P06336 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
P06336 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
P06336 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
P06336 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P06336 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P06336 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
P06336 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
P06336 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P06336 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
P06336 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P06336 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P06336 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P06336 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P06336 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P06336 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
P06336 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P06336 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P06336 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P06336 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P06336 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P06336 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms