Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ItgamP05555 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ItgamP05555 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ItgamP05555 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ItgamP05555 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ItgamP05555 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ItgamP05555 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ItgamP05555 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ItgamP05555 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ItgamP05555 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ItgamP05555 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ItgamP05555 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ItgamP05555 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ItgamP05555 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ItgamP05555 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ItgamP05555 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ItgamP05555 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ItgamP05555 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ItgamP05555 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ItgamP05555 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ItgamP05555 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ItgamP05555 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ItgamP05555 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ItgamP05555 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ItgamP05555 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ItgamP05555 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ItgamP05555 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ItgamP05555 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ItgamP05555 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ItgamP05555 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ItgamP05555 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ItgamP05555 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ItgamP05555 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ItgamP05555 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ItgamP05555 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ItgamP05555 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ItgamP05555 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ItgamP05555 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ItgamP05555 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ItgamP05555 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ItgamP05555 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ItgamP05555 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ItgamP05555 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ItgamP05555 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ItgamP05555 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ItgamP05555 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ItgamP05555 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ItgamP05555 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ItgamP05555 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ItgamP05555 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ItgamP05555 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ItgamP05555 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ItgamP05555 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ItgamP05555 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ItgamP05555 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ItgamP05555 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ItgamP05555 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ItgamP05555 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ItgamP05555 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ItgamP05555 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ItgamP05555 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ItgamP05555 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ItgamP05555 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ItgamP05555 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ItgamP05555 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ItgamP05555 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ItgamP05555 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ItgamP05555 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ItgamP05555 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ItgamP05555 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ItgamP05555 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ItgamP05555 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ItgamP05555 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ItgamP05555 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ItgamP05555 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ItgamP05555 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ItgamP05555 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ItgamP05555 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ItgamP05555 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ItgamP05555 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ItgamP05555 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ItgamP05555 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ItgamP05555 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ItgamP05555 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ItgamP05555 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ItgamP05555 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ItgamP05555 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ItgamP05555 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ItgamP05555 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ItgamP05555 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ItgamP05555 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ItgamP05555 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ItgamP05555 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ItgamP05555 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ItgamP05555 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ItgamP05555 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ItgamP05555 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ItgamP05555 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ItgamP05555 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ItgamP05555 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms