Protein–RNA interactions for Protein: P05214

Tuba3a, Tubulin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba3aP05214 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tuba3aP05214 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tuba3aP05214 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tuba3aP05214 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Tuba3aP05214 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tuba3aP05214 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tuba3aP05214 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tuba3aP05214 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tuba3aP05214 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tuba3aP05214 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tuba3aP05214 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tuba3aP05214 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tuba3aP05214 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tuba3aP05214 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tuba3aP05214 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tuba3aP05214 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tuba3aP05214 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tuba3aP05214 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tuba3aP05214 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Tuba3aP05214 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tuba3aP05214 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tuba3aP05214 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tuba3aP05214 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Tuba3aP05214 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tuba3aP05214 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tuba3aP05214 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tuba3aP05214 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tuba3aP05214 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tuba3aP05214 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tuba3aP05214 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tuba3aP05214 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tuba3aP05214 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tuba3aP05214 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tuba3aP05214 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tuba3aP05214 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tuba3aP05214 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tuba3aP05214 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tuba3aP05214 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tuba3aP05214 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tuba3aP05214 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tuba3aP05214 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tuba3aP05214 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tuba3aP05214 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tuba3aP05214 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tuba3aP05214 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tuba3aP05214 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tuba3aP05214 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tuba3aP05214 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tuba3aP05214 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tuba3aP05214 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tuba3aP05214 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tuba3aP05214 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tuba3aP05214 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Tuba3aP05214 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tuba3aP05214 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tuba3aP05214 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tuba3aP05214 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tuba3aP05214 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tuba3aP05214 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tuba3aP05214 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tuba3aP05214 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tuba3aP05214 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tuba3aP05214 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tuba3aP05214 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tuba3aP05214 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tuba3aP05214 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tuba3aP05214 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tuba3aP05214 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tuba3aP05214 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tuba3aP05214 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tuba3aP05214 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tuba3aP05214 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tuba3aP05214 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tuba3aP05214 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tuba3aP05214 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tuba3aP05214 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tuba3aP05214 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tuba3aP05214 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tuba3aP05214 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tuba3aP05214 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tuba3aP05214 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tuba3aP05214 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tuba3aP05214 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tuba3aP05214 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tuba3aP05214 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tuba3aP05214 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tuba3aP05214 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tuba3aP05214 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tuba3aP05214 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tuba3aP05214 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tuba3aP05214 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tuba3aP05214 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tuba3aP05214 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tuba3aP05214 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tuba3aP05214 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tuba3aP05214 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tuba3aP05214 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tuba3aP05214 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tuba3aP05214 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tuba3aP05214 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms