Protein–RNA interactions for Protein: P04919

Slc4a1, Band 3 anion transport protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a1P04919 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Slc4a1P04919 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Slc4a1P04919 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Slc4a1P04919 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Slc4a1P04919 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Slc4a1P04919 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Slc4a1P04919 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Slc4a1P04919 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Slc4a1P04919 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33.81■■■■□ 3
Slc4a1P04919 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Slc4a1P04919 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Slc4a1P04919 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Slc4a1P04919 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Slc4a1P04919 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Slc4a1P04919 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Slc4a1P04919 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Slc4a1P04919 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Slc4a1P04919 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Slc4a1P04919 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Slc4a1P04919 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Slc4a1P04919 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Slc4a1P04919 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Slc4a1P04919 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Slc4a1P04919 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Slc4a1P04919 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Slc4a1P04919 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Slc4a1P04919 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Slc4a1P04919 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Slc4a1P04919 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Slc4a1P04919 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Slc4a1P04919 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Slc4a1P04919 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Slc4a1P04919 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Slc4a1P04919 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Slc4a1P04919 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Slc4a1P04919 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Slc4a1P04919 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Slc4a1P04919 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Slc4a1P04919 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Slc4a1P04919 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Slc4a1P04919 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Slc4a1P04919 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Slc4a1P04919 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Slc4a1P04919 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Slc4a1P04919 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Slc4a1P04919 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Slc4a1P04919 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Slc4a1P04919 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Slc4a1P04919 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Slc4a1P04919 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Slc4a1P04919 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Slc4a1P04919 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Slc4a1P04919 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Slc4a1P04919 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Slc4a1P04919 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Slc4a1P04919 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Slc4a1P04919 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Slc4a1P04919 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Slc4a1P04919 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Slc4a1P04919 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Slc4a1P04919 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Slc4a1P04919 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Slc4a1P04919 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Slc4a1P04919 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Slc4a1P04919 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Slc4a1P04919 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Slc4a1P04919 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Slc4a1P04919 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Slc4a1P04919 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Slc4a1P04919 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Slc4a1P04919 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Slc4a1P04919 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Slc4a1P04919 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Slc4a1P04919 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Slc4a1P04919 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Slc4a1P04919 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Slc4a1P04919 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Slc4a1P04919 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Slc4a1P04919 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Slc4a1P04919 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Slc4a1P04919 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Slc4a1P04919 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Slc4a1P04919 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Slc4a1P04919 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Slc4a1P04919 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Slc4a1P04919 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Slc4a1P04919 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Slc4a1P04919 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Slc4a1P04919 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Slc4a1P04919 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Slc4a1P04919 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Slc4a1P04919 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Slc4a1P04919 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Slc4a1P04919 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Slc4a1P04919 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Slc4a1P04919 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Slc4a1P04919 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Slc4a1P04919 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Slc4a1P04919 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Slc4a1P04919 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms