Protein–RNA interactions for Protein: P01898

H2-Q10, H-2 class I histocompatibility antigen, Q10 alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q10P01898 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-Q10P01898 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-Q10P01898 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-Q10P01898 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-Q10P01898 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Q10P01898 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Q10P01898 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2-Q10P01898 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
H2-Q10P01898 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
H2-Q10P01898 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
H2-Q10P01898 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
H2-Q10P01898 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2-Q10P01898 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2-Q10P01898 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
H2-Q10P01898 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H2-Q10P01898 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2-Q10P01898 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-Q10P01898 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
H2-Q10P01898 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2-Q10P01898 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2-Q10P01898 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2-Q10P01898 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q10P01898 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H2-Q10P01898 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H2-Q10P01898 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H2-Q10P01898 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-Q10P01898 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H2-Q10P01898 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H2-Q10P01898 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-Q10P01898 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-Q10P01898 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-Q10P01898 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-Q10P01898 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-Q10P01898 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Q10P01898 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-Q10P01898 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2-Q10P01898 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Q10P01898 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2-Q10P01898 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H2-Q10P01898 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Q10P01898 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Q10P01898 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H2-Q10P01898 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-Q10P01898 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H2-Q10P01898 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Q10P01898 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Q10P01898 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
H2-Q10P01898 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q10P01898 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q10P01898 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q10P01898 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H2-Q10P01898 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H2-Q10P01898 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
H2-Q10P01898 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H2-Q10P01898 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H2-Q10P01898 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q10P01898 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H2-Q10P01898 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H2-Q10P01898 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H2-Q10P01898 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H2-Q10P01898 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H2-Q10P01898 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H2-Q10P01898 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H2-Q10P01898 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Q10P01898 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Q10P01898 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Q10P01898 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H2-Q10P01898 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H2-Q10P01898 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H2-Q10P01898 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
H2-Q10P01898 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Q10P01898 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H2-Q10P01898 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H2-Q10P01898 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Q10P01898 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Q10P01898 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Q10P01898 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Q10P01898 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H2-Q10P01898 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q10P01898 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H2-Q10P01898 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H2-Q10P01898 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q10P01898 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q10P01898 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q10P01898 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H2-Q10P01898 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-Q10P01898 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H2-Q10P01898 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-Q10P01898 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-Q10P01898 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H2-Q10P01898 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q10P01898 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q10P01898 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q10P01898 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
H2-Q10P01898 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-Q10P01898 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
H2-Q10P01898 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
H2-Q10P01898 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2-Q10P01898 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-Q10P01898 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms