Protein–RNA interactions for Protein: O88909

Slc22a8, Solute carrier family 22 member 8, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a8O88909 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc22a8O88909 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slc22a8O88909 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Slc22a8O88909 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Slc22a8O88909 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Slc22a8O88909 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slc22a8O88909 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc22a8O88909 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Slc22a8O88909 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slc22a8O88909 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slc22a8O88909 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Slc22a8O88909 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc22a8O88909 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Slc22a8O88909 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slc22a8O88909 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc22a8O88909 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc22a8O88909 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc22a8O88909 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc22a8O88909 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc22a8O88909 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc22a8O88909 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc22a8O88909 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc22a8O88909 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc22a8O88909 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc22a8O88909 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc22a8O88909 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc22a8O88909 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc22a8O88909 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc22a8O88909 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc22a8O88909 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc22a8O88909 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc22a8O88909 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc22a8O88909 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc22a8O88909 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc22a8O88909 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slc22a8O88909 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slc22a8O88909 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Slc22a8O88909 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slc22a8O88909 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slc22a8O88909 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Slc22a8O88909 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc22a8O88909 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Slc22a8O88909 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc22a8O88909 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc22a8O88909 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Slc22a8O88909 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Slc22a8O88909 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc22a8O88909 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Slc22a8O88909 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc22a8O88909 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slc22a8O88909 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc22a8O88909 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc22a8O88909 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc22a8O88909 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc22a8O88909 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc22a8O88909 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc22a8O88909 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc22a8O88909 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc22a8O88909 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc22a8O88909 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc22a8O88909 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc22a8O88909 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc22a8O88909 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc22a8O88909 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc22a8O88909 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc22a8O88909 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc22a8O88909 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc22a8O88909 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc22a8O88909 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc22a8O88909 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc22a8O88909 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc22a8O88909 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc22a8O88909 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc22a8O88909 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc22a8O88909 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slc22a8O88909 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slc22a8O88909 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc22a8O88909 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slc22a8O88909 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc22a8O88909 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc22a8O88909 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc22a8O88909 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc22a8O88909 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc22a8O88909 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc22a8O88909 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc22a8O88909 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc22a8O88909 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc22a8O88909 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc22a8O88909 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc22a8O88909 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc22a8O88909 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc22a8O88909 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc22a8O88909 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc22a8O88909 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc22a8O88909 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc22a8O88909 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc22a8O88909 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc22a8O88909 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc22a8O88909 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc22a8O88909 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms