Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Kcnk4O88454 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kcnk4O88454 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kcnk4O88454 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kcnk4O88454 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kcnk4O88454 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kcnk4O88454 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kcnk4O88454 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kcnk4O88454 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kcnk4O88454 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kcnk4O88454 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kcnk4O88454 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kcnk4O88454 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kcnk4O88454 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kcnk4O88454 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kcnk4O88454 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kcnk4O88454 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kcnk4O88454 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kcnk4O88454 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kcnk4O88454 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kcnk4O88454 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kcnk4O88454 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kcnk4O88454 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kcnk4O88454 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kcnk4O88454 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kcnk4O88454 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kcnk4O88454 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kcnk4O88454 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kcnk4O88454 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kcnk4O88454 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kcnk4O88454 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Kcnk4O88454 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Kcnk4O88454 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kcnk4O88454 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kcnk4O88454 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kcnk4O88454 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Kcnk4O88454 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Kcnk4O88454 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kcnk4O88454 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kcnk4O88454 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kcnk4O88454 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kcnk4O88454 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kcnk4O88454 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kcnk4O88454 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kcnk4O88454 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kcnk4O88454 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Kcnk4O88454 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kcnk4O88454 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kcnk4O88454 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kcnk4O88454 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kcnk4O88454 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kcnk4O88454 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kcnk4O88454 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kcnk4O88454 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Kcnk4O88454 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Kcnk4O88454 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kcnk4O88454 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kcnk4O88454 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kcnk4O88454 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kcnk4O88454 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kcnk4O88454 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kcnk4O88454 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kcnk4O88454 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Kcnk4O88454 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kcnk4O88454 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Kcnk4O88454 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kcnk4O88454 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kcnk4O88454 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kcnk4O88454 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kcnk4O88454 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kcnk4O88454 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kcnk4O88454 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kcnk4O88454 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kcnk4O88454 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Kcnk4O88454 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Kcnk4O88454 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kcnk4O88454 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kcnk4O88454 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Kcnk4O88454 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kcnk4O88454 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kcnk4O88454 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kcnk4O88454 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kcnk4O88454 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kcnk4O88454 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kcnk4O88454 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kcnk4O88454 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Kcnk4O88454 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Kcnk4O88454 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kcnk4O88454 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Kcnk4O88454 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcnk4O88454 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Kcnk4O88454 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kcnk4O88454 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Kcnk4O88454 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kcnk4O88454 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Kcnk4O88454 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kcnk4O88454 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Kcnk4O88454 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Kcnk4O88454 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Kcnk4O88454 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms