Protein–RNA interactions for Protein: O54901

Cd200, OX-2 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200O54901 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,74■■□□□ 1,23
Cd200O54901 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,74■■□□□ 1,23
Cd200O54901 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Cd200O54901 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Cd200O54901 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,72■■□□□ 1,23
Cd200O54901 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Cd200O54901 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,7■■□□□ 1,22
Cd200O54901 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Cd200O54901 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,68■■□□□ 1,22
Cd200O54901 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Cd200O54901 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22,64■■□□□ 1,21
Cd200O54901 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22,63■■□□□ 1,21
Cd200O54901 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Cd200O54901 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,57■■□□□ 1,2
Cd200O54901 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,55■■□□□ 1,2
Cd200O54901 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Cd200O54901 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,53■■□□□ 1,2
Cd200O54901 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Cd200O54901 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,49■■□□□ 1,19
Cd200O54901 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Cd200O54901 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Cd200O54901 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Cd200O54901 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Cd200O54901 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
Cd200O54901 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22,37■■□□□ 1,17
Cd200O54901 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Cd200O54901 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Cd200O54901 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22,31■■□□□ 1,16
Cd200O54901 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Cd200O54901 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Cd200O54901 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Cd200O54901 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Cd200O54901 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22,27■■□□□ 1,15
Cd200O54901 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22,26■■□□□ 1,15
Cd200O54901 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Cd200O54901 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22,2■■□□□ 1,14
Cd200O54901 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22,19■■□□□ 1,14
Cd200O54901 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,19■■□□□ 1,14
Cd200O54901 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Cd200O54901 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,18■■□□□ 1,14
Cd200O54901 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Cd200O54901 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Cd200O54901 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Cd200O54901 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22,13■■□□□ 1,13
Cd200O54901 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22,09■■□□□ 1,13
Cd200O54901 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Cd200O54901 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Cd200O54901 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Cd200O54901 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1,11
Cd200O54901 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Cd200O54901 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Cd200O54901 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Cd200O54901 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21,99■■□□□ 1,11
Cd200O54901 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Cd200O54901 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Cd200O54901 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21,97■■□□□ 1,11
Cd200O54901 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Cd200O54901 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Cd200O54901 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Cd200O54901 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Cd200O54901 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,92■■□□□ 1,1
Cd200O54901 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,91■■□□□ 1,1
Cd200O54901 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,9■■□□□ 1,1
Cd200O54901 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21,88■■□□□ 1,09
Cd200O54901 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Cd200O54901 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,87■■□□□ 1,09
Cd200O54901 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Cd200O54901 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,86■■□□□ 1,09
Cd200O54901 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Cd200O54901 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,86■■□□□ 1,09
Cd200O54901 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21,86■■□□□ 1,09
Cd200O54901 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,85■■□□□ 1,09
Cd200O54901 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21,84■■□□□ 1,09
Cd200O54901 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21,84■■□□□ 1,09
Cd200O54901 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,09
Cd200O54901 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,83■■□□□ 1,08
Cd200O54901 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,81■■□□□ 1,08
Cd200O54901 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21,8■■□□□ 1,08
Cd200O54901 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Cd200O54901 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Cd200O54901 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,79■■□□□ 1,08
Cd200O54901 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Cd200O54901 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21,77■■□□□ 1,08
Cd200O54901 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21,77■■□□□ 1,08
Cd200O54901 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,77■■□□□ 1,08
Cd200O54901 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,74■■□□□ 1,07
Cd200O54901 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,73■■□□□ 1,07
Cd200O54901 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21,72■■□□□ 1,07
Cd200O54901 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21,72■■□□□ 1,07
Cd200O54901 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21,72■■□□□ 1,07
Cd200O54901 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Cd200O54901 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,71■■□□□ 1,07
Cd200O54901 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,7■■□□□ 1,06
Cd200O54901 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Cd200O54901 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Cd200O54901 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Cd200O54901 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21,67■■□□□ 1,06
Cd200O54901 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Cd200O54901 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21,65■■□□□ 1,06
Cd200O54901 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms