Protein–RNA interactions for Protein: O35972

Mrpl23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 146 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl23O35972 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Mrpl23O35972 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mrpl23O35972 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mrpl23O35972 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mrpl23O35972 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mrpl23O35972 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mrpl23O35972 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mrpl23O35972 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mrpl23O35972 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mrpl23O35972 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mrpl23O35972 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mrpl23O35972 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mrpl23O35972 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mrpl23O35972 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mrpl23O35972 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mrpl23O35972 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mrpl23O35972 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mrpl23O35972 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mrpl23O35972 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl23O35972 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mrpl23O35972 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Mrpl23O35972 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mrpl23O35972 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mrpl23O35972 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mrpl23O35972 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mrpl23O35972 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrpl23O35972 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrpl23O35972 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrpl23O35972 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl23O35972 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrpl23O35972 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrpl23O35972 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrpl23O35972 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrpl23O35972 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrpl23O35972 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrpl23O35972 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl23O35972 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl23O35972 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrpl23O35972 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrpl23O35972 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl23O35972 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl23O35972 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mrpl23O35972 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrpl23O35972 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrpl23O35972 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mrpl23O35972 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrpl23O35972 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrpl23O35972 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrpl23O35972 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mrpl23O35972 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mrpl23O35972 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mrpl23O35972 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mrpl23O35972 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl23O35972 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl23O35972 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrpl23O35972 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrpl23O35972 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrpl23O35972 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrpl23O35972 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mrpl23O35972 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mrpl23O35972 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mrpl23O35972 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mrpl23O35972 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Mrpl23O35972 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mrpl23O35972 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mrpl23O35972 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl23O35972 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mrpl23O35972 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mrpl23O35972 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mrpl23O35972 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mrpl23O35972 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mrpl23O35972 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mrpl23O35972 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Mrpl23O35972 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mrpl23O35972 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl23O35972 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mrpl23O35972 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mrpl23O35972 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mrpl23O35972 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl23O35972 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl23O35972 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mrpl23O35972 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mrpl23O35972 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mrpl23O35972 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mrpl23O35972 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mrpl23O35972 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrpl23O35972 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Mrpl23O35972 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl23O35972 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl23O35972 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Mrpl23O35972 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl23O35972 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mrpl23O35972 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Mrpl23O35972 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl23O35972 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mrpl23O35972 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Mrpl23O35972 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mrpl23O35972 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mrpl23O35972 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mrpl23O35972 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms