Protein–RNA interactions for Protein: O35709

Enc1, Ectoderm-neural cortex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Enc1O35709 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Enc1O35709 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Enc1O35709 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Enc1O35709 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Enc1O35709 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Enc1O35709 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Enc1O35709 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Enc1O35709 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Enc1O35709 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Enc1O35709 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Enc1O35709 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Enc1O35709 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Enc1O35709 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Enc1O35709 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Enc1O35709 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Enc1O35709 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Enc1O35709 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Enc1O35709 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Enc1O35709 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Enc1O35709 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Enc1O35709 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Enc1O35709 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Enc1O35709 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Enc1O35709 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Enc1O35709 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Enc1O35709 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Enc1O35709 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Enc1O35709 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Enc1O35709 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Enc1O35709 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Enc1O35709 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Enc1O35709 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Enc1O35709 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Enc1O35709 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Enc1O35709 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Enc1O35709 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Enc1O35709 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Enc1O35709 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Enc1O35709 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Enc1O35709 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Enc1O35709 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Enc1O35709 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Enc1O35709 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Enc1O35709 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Enc1O35709 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Enc1O35709 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Enc1O35709 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Enc1O35709 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Enc1O35709 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Enc1O35709 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Enc1O35709 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Enc1O35709 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Enc1O35709 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Enc1O35709 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Enc1O35709 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Enc1O35709 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Enc1O35709 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Enc1O35709 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Enc1O35709 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Enc1O35709 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Enc1O35709 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Enc1O35709 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Enc1O35709 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Enc1O35709 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Enc1O35709 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Enc1O35709 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Enc1O35709 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Enc1O35709 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Enc1O35709 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Enc1O35709 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Enc1O35709 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Enc1O35709 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Enc1O35709 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Enc1O35709 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Enc1O35709 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Enc1O35709 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Enc1O35709 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Enc1O35709 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Enc1O35709 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Enc1O35709 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Enc1O35709 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Enc1O35709 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Enc1O35709 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Enc1O35709 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Enc1O35709 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Enc1O35709 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Enc1O35709 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Enc1O35709 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Enc1O35709 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Enc1O35709 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Enc1O35709 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Enc1O35709 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Enc1O35709 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Enc1O35709 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Enc1O35709 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Enc1O35709 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Enc1O35709 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Enc1O35709 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Enc1O35709 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Enc1O35709 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms