Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc18a3O35304 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc18a3O35304 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc18a3O35304 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc18a3O35304 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc18a3O35304 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc18a3O35304 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc18a3O35304 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc18a3O35304 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc18a3O35304 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc18a3O35304 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc18a3O35304 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc18a3O35304 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc18a3O35304 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc18a3O35304 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc18a3O35304 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc18a3O35304 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc18a3O35304 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc18a3O35304 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Slc18a3O35304 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc18a3O35304 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc18a3O35304 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc18a3O35304 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc18a3O35304 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc18a3O35304 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc18a3O35304 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc18a3O35304 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc18a3O35304 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc18a3O35304 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc18a3O35304 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc18a3O35304 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc18a3O35304 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc18a3O35304 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc18a3O35304 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc18a3O35304 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc18a3O35304 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc18a3O35304 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc18a3O35304 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc18a3O35304 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc18a3O35304 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc18a3O35304 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc18a3O35304 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc18a3O35304 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc18a3O35304 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc18a3O35304 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc18a3O35304 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slc18a3O35304 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc18a3O35304 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc18a3O35304 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc18a3O35304 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc18a3O35304 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc18a3O35304 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc18a3O35304 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc18a3O35304 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc18a3O35304 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc18a3O35304 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc18a3O35304 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc18a3O35304 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc18a3O35304 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc18a3O35304 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc18a3O35304 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc18a3O35304 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc18a3O35304 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc18a3O35304 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc18a3O35304 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc18a3O35304 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc18a3O35304 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc18a3O35304 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc18a3O35304 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc18a3O35304 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc18a3O35304 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc18a3O35304 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc18a3O35304 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc18a3O35304 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc18a3O35304 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc18a3O35304 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc18a3O35304 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc18a3O35304 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc18a3O35304 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc18a3O35304 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc18a3O35304 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc18a3O35304 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc18a3O35304 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc18a3O35304 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc18a3O35304 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc18a3O35304 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc18a3O35304 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc18a3O35304 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc18a3O35304 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc18a3O35304 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc18a3O35304 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc18a3O35304 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc18a3O35304 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc18a3O35304 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc18a3O35304 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc18a3O35304 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc18a3O35304 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc18a3O35304 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc18a3O35304 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc18a3O35304 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.1 ms