Protein–RNA interactions for Protein: O35214

Rrh, Visual pigment-like receptor peropsin, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrhO35214 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RrhO35214 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RrhO35214 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RrhO35214 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RrhO35214 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RrhO35214 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RrhO35214 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RrhO35214 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RrhO35214 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RrhO35214 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RrhO35214 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RrhO35214 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RrhO35214 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RrhO35214 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RrhO35214 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RrhO35214 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RrhO35214 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RrhO35214 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RrhO35214 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RrhO35214 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RrhO35214 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RrhO35214 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RrhO35214 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RrhO35214 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RrhO35214 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RrhO35214 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RrhO35214 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RrhO35214 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RrhO35214 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RrhO35214 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RrhO35214 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RrhO35214 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RrhO35214 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RrhO35214 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RrhO35214 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RrhO35214 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RrhO35214 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RrhO35214 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RrhO35214 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RrhO35214 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RrhO35214 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RrhO35214 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RrhO35214 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RrhO35214 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RrhO35214 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RrhO35214 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RrhO35214 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RrhO35214 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RrhO35214 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RrhO35214 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RrhO35214 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RrhO35214 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RrhO35214 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RrhO35214 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RrhO35214 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RrhO35214 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RrhO35214 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RrhO35214 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RrhO35214 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RrhO35214 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RrhO35214 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RrhO35214 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RrhO35214 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RrhO35214 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RrhO35214 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RrhO35214 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RrhO35214 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RrhO35214 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RrhO35214 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RrhO35214 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RrhO35214 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RrhO35214 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RrhO35214 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RrhO35214 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RrhO35214 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RrhO35214 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RrhO35214 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RrhO35214 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RrhO35214 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RrhO35214 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RrhO35214 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RrhO35214 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RrhO35214 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RrhO35214 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RrhO35214 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RrhO35214 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RrhO35214 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RrhO35214 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RrhO35214 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RrhO35214 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RrhO35214 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RrhO35214 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RrhO35214 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RrhO35214 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RrhO35214 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RrhO35214 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RrhO35214 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RrhO35214 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RrhO35214 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RrhO35214 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms