Protein–RNA interactions for Protein: O35127

Grcc10, Protein C10, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grcc10O35127 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grcc10O35127 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grcc10O35127 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Grcc10O35127 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grcc10O35127 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grcc10O35127 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grcc10O35127 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grcc10O35127 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grcc10O35127 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grcc10O35127 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Grcc10O35127 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grcc10O35127 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grcc10O35127 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grcc10O35127 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grcc10O35127 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grcc10O35127 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Grcc10O35127 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Grcc10O35127 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Grcc10O35127 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grcc10O35127 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Grcc10O35127 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grcc10O35127 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Grcc10O35127 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Grcc10O35127 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grcc10O35127 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Grcc10O35127 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grcc10O35127 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Grcc10O35127 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grcc10O35127 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grcc10O35127 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Grcc10O35127 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Grcc10O35127 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Grcc10O35127 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Grcc10O35127 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Grcc10O35127 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grcc10O35127 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Grcc10O35127 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Grcc10O35127 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grcc10O35127 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Grcc10O35127 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grcc10O35127 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Grcc10O35127 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grcc10O35127 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grcc10O35127 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Grcc10O35127 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Grcc10O35127 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grcc10O35127 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Grcc10O35127 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Grcc10O35127 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Grcc10O35127 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grcc10O35127 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grcc10O35127 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Grcc10O35127 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Grcc10O35127 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Grcc10O35127 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grcc10O35127 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grcc10O35127 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Grcc10O35127 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Grcc10O35127 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grcc10O35127 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Grcc10O35127 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grcc10O35127 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Grcc10O35127 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Grcc10O35127 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grcc10O35127 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grcc10O35127 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grcc10O35127 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Grcc10O35127 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grcc10O35127 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Grcc10O35127 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Grcc10O35127 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grcc10O35127 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Grcc10O35127 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grcc10O35127 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Grcc10O35127 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Grcc10O35127 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Grcc10O35127 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grcc10O35127 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grcc10O35127 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Grcc10O35127 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Grcc10O35127 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Grcc10O35127 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Grcc10O35127 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Grcc10O35127 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Grcc10O35127 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grcc10O35127 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grcc10O35127 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Grcc10O35127 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Grcc10O35127 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Grcc10O35127 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grcc10O35127 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grcc10O35127 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Grcc10O35127 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grcc10O35127 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Grcc10O35127 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grcc10O35127 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grcc10O35127 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Grcc10O35127 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grcc10O35127 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Grcc10O35127 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms