Protein–RNA interactions for Protein: O09174

Amacr, Alpha-methylacyl-CoA racemase, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmacrO09174 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AmacrO09174 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
AmacrO09174 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AmacrO09174 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AmacrO09174 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AmacrO09174 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AmacrO09174 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AmacrO09174 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AmacrO09174 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AmacrO09174 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AmacrO09174 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AmacrO09174 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AmacrO09174 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AmacrO09174 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AmacrO09174 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AmacrO09174 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AmacrO09174 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AmacrO09174 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AmacrO09174 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AmacrO09174 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AmacrO09174 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AmacrO09174 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AmacrO09174 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
AmacrO09174 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AmacrO09174 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AmacrO09174 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
AmacrO09174 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AmacrO09174 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AmacrO09174 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AmacrO09174 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AmacrO09174 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AmacrO09174 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AmacrO09174 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AmacrO09174 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AmacrO09174 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AmacrO09174 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AmacrO09174 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AmacrO09174 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AmacrO09174 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AmacrO09174 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AmacrO09174 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AmacrO09174 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AmacrO09174 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AmacrO09174 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AmacrO09174 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
AmacrO09174 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
AmacrO09174 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AmacrO09174 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
AmacrO09174 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AmacrO09174 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AmacrO09174 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AmacrO09174 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
AmacrO09174 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AmacrO09174 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AmacrO09174 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
AmacrO09174 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AmacrO09174 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
AmacrO09174 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
AmacrO09174 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AmacrO09174 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AmacrO09174 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AmacrO09174 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
AmacrO09174 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AmacrO09174 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AmacrO09174 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AmacrO09174 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AmacrO09174 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AmacrO09174 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AmacrO09174 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AmacrO09174 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AmacrO09174 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
AmacrO09174 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AmacrO09174 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AmacrO09174 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AmacrO09174 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
AmacrO09174 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AmacrO09174 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AmacrO09174 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AmacrO09174 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
AmacrO09174 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AmacrO09174 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AmacrO09174 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AmacrO09174 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AmacrO09174 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AmacrO09174 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AmacrO09174 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AmacrO09174 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AmacrO09174 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AmacrO09174 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AmacrO09174 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AmacrO09174 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AmacrO09174 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AmacrO09174 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
AmacrO09174 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
AmacrO09174 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AmacrO09174 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AmacrO09174 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AmacrO09174 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AmacrO09174 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AmacrO09174 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms