Protein–RNA interactions for Protein: O08848

Trove2, 60 kDa SS-A/Ro ribonucleoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trove2O08848 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trove2O08848 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trove2O08848 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trove2O08848 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Trove2O08848 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trove2O08848 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trove2O08848 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Trove2O08848 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Trove2O08848 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Trove2O08848 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trove2O08848 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trove2O08848 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trove2O08848 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trove2O08848 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trove2O08848 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trove2O08848 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trove2O08848 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trove2O08848 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trove2O08848 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trove2O08848 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trove2O08848 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trove2O08848 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trove2O08848 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trove2O08848 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trove2O08848 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trove2O08848 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trove2O08848 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trove2O08848 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trove2O08848 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trove2O08848 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trove2O08848 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trove2O08848 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trove2O08848 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trove2O08848 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trove2O08848 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trove2O08848 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trove2O08848 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trove2O08848 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Trove2O08848 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Trove2O08848 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Trove2O08848 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trove2O08848 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Trove2O08848 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trove2O08848 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trove2O08848 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trove2O08848 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trove2O08848 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trove2O08848 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trove2O08848 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trove2O08848 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trove2O08848 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trove2O08848 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trove2O08848 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Trove2O08848 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trove2O08848 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trove2O08848 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trove2O08848 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trove2O08848 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Trove2O08848 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trove2O08848 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trove2O08848 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trove2O08848 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trove2O08848 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trove2O08848 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trove2O08848 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trove2O08848 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trove2O08848 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trove2O08848 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trove2O08848 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trove2O08848 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trove2O08848 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Trove2O08848 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trove2O08848 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trove2O08848 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Trove2O08848 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trove2O08848 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trove2O08848 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Trove2O08848 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trove2O08848 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trove2O08848 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trove2O08848 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trove2O08848 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trove2O08848 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trove2O08848 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trove2O08848 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trove2O08848 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trove2O08848 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trove2O08848 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trove2O08848 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trove2O08848 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trove2O08848 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trove2O08848 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trove2O08848 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trove2O08848 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trove2O08848 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trove2O08848 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trove2O08848 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trove2O08848 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trove2O08848 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trove2O08848 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms