Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MttpO08601 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MttpO08601 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MttpO08601 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MttpO08601 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MttpO08601 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MttpO08601 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MttpO08601 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MttpO08601 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MttpO08601 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MttpO08601 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MttpO08601 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MttpO08601 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MttpO08601 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MttpO08601 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MttpO08601 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MttpO08601 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MttpO08601 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MttpO08601 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MttpO08601 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MttpO08601 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MttpO08601 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MttpO08601 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
MttpO08601 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MttpO08601 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MttpO08601 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MttpO08601 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MttpO08601 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MttpO08601 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MttpO08601 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MttpO08601 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MttpO08601 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MttpO08601 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MttpO08601 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MttpO08601 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MttpO08601 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MttpO08601 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MttpO08601 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MttpO08601 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MttpO08601 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MttpO08601 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MttpO08601 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MttpO08601 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MttpO08601 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
MttpO08601 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MttpO08601 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MttpO08601 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MttpO08601 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MttpO08601 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MttpO08601 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MttpO08601 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MttpO08601 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MttpO08601 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MttpO08601 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MttpO08601 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MttpO08601 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MttpO08601 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MttpO08601 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MttpO08601 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MttpO08601 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MttpO08601 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MttpO08601 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MttpO08601 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MttpO08601 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MttpO08601 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MttpO08601 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MttpO08601 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MttpO08601 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MttpO08601 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MttpO08601 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MttpO08601 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MttpO08601 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MttpO08601 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MttpO08601 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MttpO08601 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MttpO08601 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MttpO08601 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MttpO08601 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MttpO08601 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MttpO08601 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MttpO08601 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MttpO08601 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MttpO08601 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MttpO08601 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MttpO08601 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MttpO08601 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MttpO08601 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MttpO08601 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MttpO08601 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MttpO08601 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MttpO08601 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
MttpO08601 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MttpO08601 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MttpO08601 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MttpO08601 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MttpO08601 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MttpO08601 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MttpO08601 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MttpO08601 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MttpO08601 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
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