Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,05■■■□□ 2,08
Klf6O08584 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Klf6O08584 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,04■■■□□ 2,08
Klf6O08584 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Klf6O08584 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Klf6O08584 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28,02■■■□□ 2,08
Klf6O08584 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Klf6O08584 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Klf6O08584 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Klf6O08584 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Klf6O08584 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,85■■■□□ 2,05
Klf6O08584 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Klf6O08584 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Klf6O08584 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,82■■■□□ 2,04
Klf6O08584 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Klf6O08584 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Klf6O08584 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Klf6O08584 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Klf6O08584 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Klf6O08584 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,72■■■□□ 2,03
Klf6O08584 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Klf6O08584 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Klf6O08584 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,67■■■□□ 2,02
Klf6O08584 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Klf6O08584 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Klf6O08584 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Klf6O08584 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Klf6O08584 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Klf6O08584 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Klf6O08584 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Klf6O08584 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Klf6O08584 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Klf6O08584 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,46■■□□□ 1,99
Klf6O08584 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27,46■■□□□ 1,99
Klf6O08584 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Klf6O08584 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Klf6O08584 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Klf6O08584 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Klf6O08584 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Klf6O08584 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Klf6O08584 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Klf6O08584 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Klf6O08584 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Klf6O08584 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Klf6O08584 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,27■■□□□ 1,96
Klf6O08584 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Klf6O08584 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Klf6O08584 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27,22■■□□□ 1,95
Klf6O08584 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Klf6O08584 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Klf6O08584 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Klf6O08584 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Klf6O08584 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Klf6O08584 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Klf6O08584 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Klf6O08584 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Klf6O08584 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Klf6O08584 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Klf6O08584 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Klf6O08584 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Klf6O08584 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Klf6O08584 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Klf6O08584 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Klf6O08584 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Klf6O08584 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Klf6O08584 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Klf6O08584 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Klf6O08584 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Klf6O08584 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26,88■■□□□ 1,89
Klf6O08584 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Klf6O08584 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Klf6O08584 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Klf6O08584 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
Klf6O08584 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Klf6O08584 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Klf6O08584 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Klf6O08584 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Klf6O08584 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Klf6O08584 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Klf6O08584 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,78■■□□□ 1,88
Klf6O08584 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,77■■□□□ 1,88
Klf6O08584 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Klf6O08584 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Klf6O08584 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,75■■□□□ 1,87
Klf6O08584 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Klf6O08584 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Klf6O08584 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Klf6O08584 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Klf6O08584 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Klf6O08584 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Klf6O08584 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Klf6O08584 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,61■■□□□ 1,85
Klf6O08584 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Klf6O08584 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Klf6O08584 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Klf6O08584 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Klf6O08584 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Klf6O08584 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Klf6O08584 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Klf6O08584 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34,1 ms