Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Cacna2d1O08532 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Cacna2d1O08532 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
Cacna2d1O08532 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Cacna2d1O08532 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Cacna2d1O08532 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Cacna2d1O08532 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Cacna2d1O08532 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,33■■■□□ 2,29
Cacna2d1O08532 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Cacna2d1O08532 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Cacna2d1O08532 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Cacna2d1O08532 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Cacna2d1O08532 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Cacna2d1O08532 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Cacna2d1O08532 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Cacna2d1O08532 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Cacna2d1O08532 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Cacna2d1O08532 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Cacna2d1O08532 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Cacna2d1O08532 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Cacna2d1O08532 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Cacna2d1O08532 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29,13■■■□□ 2,25
Cacna2d1O08532 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Cacna2d1O08532 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29,08■■■□□ 2,25
Cacna2d1O08532 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Cacna2d1O08532 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Cacna2d1O08532 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Cacna2d1O08532 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Cacna2d1O08532 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Cacna2d1O08532 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Cacna2d1O08532 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Cacna2d1O08532 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Cacna2d1O08532 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28,91■■■□□ 2,22
Cacna2d1O08532 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Cacna2d1O08532 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Cacna2d1O08532 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Cacna2d1O08532 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Cacna2d1O08532 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Cacna2d1O08532 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Cacna2d1O08532 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Cacna2d1O08532 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Cacna2d1O08532 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Cacna2d1O08532 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,19
Cacna2d1O08532 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28,67■■■□□ 2,18
Cacna2d1O08532 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Cacna2d1O08532 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28,64■■■□□ 2,18
Cacna2d1O08532 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Cacna2d1O08532 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Cacna2d1O08532 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Cacna2d1O08532 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28,6■■■□□ 2,17
Cacna2d1O08532 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Cacna2d1O08532 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Cacna2d1O08532 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Cacna2d1O08532 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Cacna2d1O08532 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Cacna2d1O08532 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Cacna2d1O08532 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
Cacna2d1O08532 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28,48■■■□□ 2,15
Cacna2d1O08532 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Cacna2d1O08532 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Cacna2d1O08532 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,15
Cacna2d1O08532 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Cacna2d1O08532 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Cacna2d1O08532 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Cacna2d1O08532 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Cacna2d1O08532 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Cacna2d1O08532 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Cacna2d1O08532 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,26■■■□□ 2,11
Cacna2d1O08532 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Cacna2d1O08532 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Cacna2d1O08532 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Cacna2d1O08532 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,23■■■□□ 2,11
Cacna2d1O08532 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Cacna2d1O08532 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Cacna2d1O08532 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Cacna2d1O08532 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Cacna2d1O08532 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,19■■■□□ 2,1
Cacna2d1O08532 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Cacna2d1O08532 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Cacna2d1O08532 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Cacna2d1O08532 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
Cacna2d1O08532 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Cacna2d1O08532 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Cacna2d1O08532 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Cacna2d1O08532 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28,11■■■□□ 2,09
Cacna2d1O08532 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Cacna2d1O08532 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Cacna2d1O08532 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Cacna2d1O08532 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Cacna2d1O08532 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Cacna2d1O08532 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Cacna2d1O08532 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Cacna2d1O08532 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Cacna2d1O08532 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27,97■■■□□ 2,07
Cacna2d1O08532 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Cacna2d1O08532 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Cacna2d1O08532 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Cacna2d1O08532 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Cacna2d1O08532 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Cacna2d1O08532 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33,8 ms