Protein–RNA interactions for Protein: J3QN86

Gm21882, Predicted gene, 21882, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21882J3QN86 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm21882J3QN86 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21882J3QN86 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21882J3QN86 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm21882J3QN86 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm21882J3QN86 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm21882J3QN86 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm21882J3QN86 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21882J3QN86 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21882J3QN86 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm21882J3QN86 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm21882J3QN86 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm21882J3QN86 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm21882J3QN86 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm21882J3QN86 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm21882J3QN86 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm21882J3QN86 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm21882J3QN86 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm21882J3QN86 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21882J3QN86 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21882J3QN86 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21882J3QN86 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21882J3QN86 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21882J3QN86 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21882J3QN86 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21882J3QN86 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm21882J3QN86 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm21882J3QN86 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21882J3QN86 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21882J3QN86 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21882J3QN86 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm21882J3QN86 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21882J3QN86 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm21882J3QN86 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm21882J3QN86 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21882J3QN86 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21882J3QN86 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21882J3QN86 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21882J3QN86 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm21882J3QN86 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm21882J3QN86 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21882J3QN86 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21882J3QN86 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21882J3QN86 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21882J3QN86 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21882J3QN86 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm21882J3QN86 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21882J3QN86 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21882J3QN86 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21882J3QN86 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21882J3QN86 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21882J3QN86 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21882J3QN86 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21882J3QN86 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21882J3QN86 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21882J3QN86 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm21882J3QN86 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm21882J3QN86 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm21882J3QN86 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm21882J3QN86 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm21882J3QN86 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm21882J3QN86 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm21882J3QN86 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm21882J3QN86 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm21882J3QN86 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm21882J3QN86 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm21882J3QN86 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm21882J3QN86 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm21882J3QN86 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm21882J3QN86 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm21882J3QN86 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm21882J3QN86 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm21882J3QN86 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm21882J3QN86 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm21882J3QN86 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm21882J3QN86 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm21882J3QN86 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm21882J3QN86 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm21882J3QN86 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm21882J3QN86 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm21882J3QN86 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm21882J3QN86 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm21882J3QN86 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm21882J3QN86 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm21882J3QN86 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm21882J3QN86 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm21882J3QN86 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm21882J3QN86 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm21882J3QN86 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm21882J3QN86 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm21882J3QN86 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm21882J3QN86 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm21882J3QN86 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm21882J3QN86 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm21882J3QN86 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm21882J3QN86 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm21882J3QN86 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm21882J3QN86 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm21882J3QN86 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm21882J3QN86 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms