Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Lipo1J3QME6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Lipo1J3QME6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Lipo1J3QME6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lipo1J3QME6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lipo1J3QME6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lipo1J3QME6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lipo1J3QME6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lipo1J3QME6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lipo1J3QME6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lipo1J3QME6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lipo1J3QME6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lipo1J3QME6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lipo1J3QME6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lipo1J3QME6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lipo1J3QME6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lipo1J3QME6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Lipo1J3QME6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Lipo1J3QME6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Lipo1J3QME6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lipo1J3QME6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Lipo1J3QME6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Lipo1J3QME6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lipo1J3QME6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lipo1J3QME6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lipo1J3QME6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lipo1J3QME6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lipo1J3QME6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lipo1J3QME6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lipo1J3QME6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lipo1J3QME6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Lipo1J3QME6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Lipo1J3QME6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Lipo1J3QME6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Lipo1J3QME6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Lipo1J3QME6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lipo1J3QME6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Lipo1J3QME6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Lipo1J3QME6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
Lipo1J3QME6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Lipo1J3QME6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Lipo1J3QME6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Lipo1J3QME6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Lipo1J3QME6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
Lipo1J3QME6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Lipo1J3QME6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Lipo1J3QME6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Lipo1J3QME6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Lipo1J3QME6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Lipo1J3QME6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Lipo1J3QME6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Lipo1J3QME6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Lipo1J3QME6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Lipo1J3QME6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Lipo1J3QME6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Lipo1J3QME6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Lipo1J3QME6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Lipo1J3QME6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Lipo1J3QME6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Lipo1J3QME6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Lipo1J3QME6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Lipo1J3QME6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Lipo1J3QME6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Lipo1J3QME6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Lipo1J3QME6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Lipo1J3QME6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Lipo1J3QME6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Lipo1J3QME6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Lipo1J3QME6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Lipo1J3QME6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Lipo1J3QME6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Lipo1J3QME6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Lipo1J3QME6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Lipo1J3QME6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Lipo1J3QME6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Lipo1J3QME6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Lipo1J3QME6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Lipo1J3QME6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Lipo1J3QME6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
Lipo1J3QME6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Lipo1J3QME6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lipo1J3QME6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lipo1J3QME6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Lipo1J3QME6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Lipo1J3QME6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lipo1J3QME6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lipo1J3QME6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Lipo1J3QME6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Lipo1J3QME6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Lipo1J3QME6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Lipo1J3QME6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Lipo1J3QME6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Lipo1J3QME6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Lipo1J3QME6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Lipo1J3QME6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lipo1J3QME6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Lipo1J3QME6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lipo1J3QME6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Lipo1J3QME6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Lipo1J3QME6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms