Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm21818J3KMS6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm21818J3KMS6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm21818J3KMS6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm21818J3KMS6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm21818J3KMS6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm21818J3KMS6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm21818J3KMS6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm21818J3KMS6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm21818J3KMS6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm21818J3KMS6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm21818J3KMS6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm21818J3KMS6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21818J3KMS6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm21818J3KMS6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm21818J3KMS6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm21818J3KMS6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm21818J3KMS6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gm21818J3KMS6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm21818J3KMS6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm21818J3KMS6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm21818J3KMS6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm21818J3KMS6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm21818J3KMS6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm21818J3KMS6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm21818J3KMS6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm21818J3KMS6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm21818J3KMS6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm21818J3KMS6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm21818J3KMS6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21818J3KMS6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm21818J3KMS6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm21818J3KMS6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm21818J3KMS6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm21818J3KMS6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21818J3KMS6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm21818J3KMS6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm21818J3KMS6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm21818J3KMS6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm21818J3KMS6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm21818J3KMS6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm21818J3KMS6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm21818J3KMS6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm21818J3KMS6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm21818J3KMS6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm21818J3KMS6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm21818J3KMS6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21818J3KMS6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm21818J3KMS6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21818J3KMS6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21818J3KMS6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm21818J3KMS6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm21818J3KMS6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm21818J3KMS6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21818J3KMS6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm21818J3KMS6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm21818J3KMS6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21818J3KMS6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21818J3KMS6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm21818J3KMS6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm21818J3KMS6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm21818J3KMS6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21818J3KMS6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm21818J3KMS6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21818J3KMS6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21818J3KMS6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm21818J3KMS6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm21818J3KMS6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm21818J3KMS6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm21818J3KMS6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm21818J3KMS6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21818J3KMS6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21818J3KMS6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21818J3KMS6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm21818J3KMS6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm21818J3KMS6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm21818J3KMS6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21818J3KMS6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21818J3KMS6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21818J3KMS6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm21818J3KMS6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm21818J3KMS6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm21818J3KMS6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm21818J3KMS6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21818J3KMS6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm21818J3KMS6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm21818J3KMS6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm21818J3KMS6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21818J3KMS6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm21818J3KMS6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm21818J3KMS6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21818J3KMS6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm21818J3KMS6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21818J3KMS6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm21818J3KMS6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm21818J3KMS6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21818J3KMS6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm21818J3KMS6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm21818J3KMS6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm21818J3KMS6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms