Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r67G5E8C1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn1r67G5E8C1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn1r67G5E8C1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn1r67G5E8C1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn1r67G5E8C1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vmn1r67G5E8C1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn1r67G5E8C1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn1r67G5E8C1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vmn1r67G5E8C1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r67G5E8C1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn1r67G5E8C1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r67G5E8C1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vmn1r67G5E8C1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn1r67G5E8C1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r67G5E8C1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r67G5E8C1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn1r67G5E8C1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r67G5E8C1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r67G5E8C1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r67G5E8C1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r67G5E8C1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vmn1r67G5E8C1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r67G5E8C1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r67G5E8C1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r67G5E8C1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r67G5E8C1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r67G5E8C1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r67G5E8C1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r67G5E8C1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r67G5E8C1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r67G5E8C1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r67G5E8C1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r67G5E8C1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r67G5E8C1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r67G5E8C1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r67G5E8C1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r67G5E8C1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r67G5E8C1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r67G5E8C1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r67G5E8C1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r67G5E8C1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r67G5E8C1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r67G5E8C1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r67G5E8C1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r67G5E8C1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r67G5E8C1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r67G5E8C1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r67G5E8C1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn1r67G5E8C1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn1r67G5E8C1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r67G5E8C1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r67G5E8C1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r67G5E8C1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r67G5E8C1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r67G5E8C1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r67G5E8C1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r67G5E8C1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r67G5E8C1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r67G5E8C1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r67G5E8C1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r67G5E8C1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r67G5E8C1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r67G5E8C1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r67G5E8C1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r67G5E8C1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r67G5E8C1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r67G5E8C1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r67G5E8C1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r67G5E8C1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r67G5E8C1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r67G5E8C1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r67G5E8C1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r67G5E8C1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r67G5E8C1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r67G5E8C1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r67G5E8C1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r67G5E8C1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r67G5E8C1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r67G5E8C1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r67G5E8C1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r67G5E8C1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r67G5E8C1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r67G5E8C1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r67G5E8C1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r67G5E8C1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r67G5E8C1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r67G5E8C1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r67G5E8C1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r67G5E8C1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r67G5E8C1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r67G5E8C1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r67G5E8C1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r67G5E8C1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r67G5E8C1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r67G5E8C1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r67G5E8C1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r67G5E8C1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r67G5E8C1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms