Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5218F6YH22 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm5218F6YH22 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm5218F6YH22 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm5218F6YH22 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm5218F6YH22 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm5218F6YH22 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm5218F6YH22 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm5218F6YH22 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm5218F6YH22 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm5218F6YH22 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm5218F6YH22 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm5218F6YH22 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gm5218F6YH22 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm5218F6YH22 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gm5218F6YH22 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm5218F6YH22 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5218F6YH22 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm5218F6YH22 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm5218F6YH22 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5218F6YH22 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5218F6YH22 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm5218F6YH22 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm5218F6YH22 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm5218F6YH22 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm5218F6YH22 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm5218F6YH22 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm5218F6YH22 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm5218F6YH22 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm5218F6YH22 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm5218F6YH22 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm5218F6YH22 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm5218F6YH22 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5218F6YH22 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5218F6YH22 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5218F6YH22 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5218F6YH22 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5218F6YH22 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5218F6YH22 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5218F6YH22 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5218F6YH22 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5218F6YH22 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5218F6YH22 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5218F6YH22 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5218F6YH22 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5218F6YH22 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5218F6YH22 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5218F6YH22 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5218F6YH22 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5218F6YH22 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5218F6YH22 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5218F6YH22 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5218F6YH22 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5218F6YH22 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5218F6YH22 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5218F6YH22 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5218F6YH22 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5218F6YH22 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5218F6YH22 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5218F6YH22 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5218F6YH22 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5218F6YH22 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm5218F6YH22 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5218F6YH22 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5218F6YH22 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm5218F6YH22 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm5218F6YH22 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5218F6YH22 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm5218F6YH22 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm5218F6YH22 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5218F6YH22 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm5218F6YH22 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm5218F6YH22 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm5218F6YH22 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm5218F6YH22 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5218F6YH22 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm5218F6YH22 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm5218F6YH22 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5218F6YH22 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5218F6YH22 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5218F6YH22 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5218F6YH22 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5218F6YH22 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5218F6YH22 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5218F6YH22 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5218F6YH22 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5218F6YH22 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5218F6YH22 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5218F6YH22 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm5218F6YH22 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm5218F6YH22 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5218F6YH22 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm5218F6YH22 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5218F6YH22 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm5218F6YH22 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm5218F6YH22 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm5218F6YH22 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm5218F6YH22 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm5218F6YH22 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm5218F6YH22 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms