Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28305F6U473 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm28305F6U473 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm28305F6U473 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm28305F6U473 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm28305F6U473 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm28305F6U473 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm28305F6U473 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm28305F6U473 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm28305F6U473 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm28305F6U473 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm28305F6U473 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm28305F6U473 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm28305F6U473 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm28305F6U473 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm28305F6U473 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm28305F6U473 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm28305F6U473 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm28305F6U473 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm28305F6U473 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm28305F6U473 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm28305F6U473 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm28305F6U473 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm28305F6U473 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm28305F6U473 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm28305F6U473 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm28305F6U473 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Gm28305F6U473 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Gm28305F6U473 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Gm28305F6U473 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Gm28305F6U473 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Gm28305F6U473 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm28305F6U473 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm28305F6U473 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm28305F6U473 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm28305F6U473 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm28305F6U473 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm28305F6U473 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm28305F6U473 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm28305F6U473 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm28305F6U473 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm28305F6U473 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28305F6U473 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm28305F6U473 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm28305F6U473 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm28305F6U473 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm28305F6U473 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm28305F6U473 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm28305F6U473 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm28305F6U473 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm28305F6U473 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm28305F6U473 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28305F6U473 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gm28305F6U473 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Gm28305F6U473 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm28305F6U473 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gm28305F6U473 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gm28305F6U473 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28305F6U473 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gm28305F6U473 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gm28305F6U473 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gm28305F6U473 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28305F6U473 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28305F6U473 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gm28305F6U473 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28305F6U473 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28305F6U473 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gm28305F6U473 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm28305F6U473 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm28305F6U473 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gm28305F6U473 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gm28305F6U473 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28305F6U473 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gm28305F6U473 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gm28305F6U473 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gm28305F6U473 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm28305F6U473 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm28305F6U473 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm28305F6U473 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gm28305F6U473 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28305F6U473 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm28305F6U473 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28305F6U473 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28305F6U473 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm28305F6U473 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28305F6U473 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm28305F6U473 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm28305F6U473 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm28305F6U473 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm28305F6U473 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28305F6U473 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28305F6U473 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28305F6U473 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28305F6U473 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28305F6U473 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28305F6U473 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28305F6U473 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28305F6U473 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28305F6U473 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28305F6U473 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms