Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Pdzd7E9Q9W7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Pdzd7E9Q9W7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Pdzd7E9Q9W7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Pdzd7E9Q9W7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Pdzd7E9Q9W7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Pdzd7E9Q9W7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Pdzd7E9Q9W7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Pdzd7E9Q9W7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Pdzd7E9Q9W7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Pdzd7E9Q9W7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Pdzd7E9Q9W7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Pdzd7E9Q9W7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Pdzd7E9Q9W7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Pdzd7E9Q9W7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,57■■■□□ 2
Pdzd7E9Q9W7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Pdzd7E9Q9W7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,5■■□□□ 1,99
Pdzd7E9Q9W7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Pdzd7E9Q9W7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Pdzd7E9Q9W7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Pdzd7E9Q9W7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Pdzd7E9Q9W7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,41■■□□□ 1,98
Pdzd7E9Q9W7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Pdzd7E9Q9W7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Pdzd7E9Q9W7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Pdzd7E9Q9W7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Pdzd7E9Q9W7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Pdzd7E9Q9W7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,29■■□□□ 1,96
Pdzd7E9Q9W7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Pdzd7E9Q9W7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Pdzd7E9Q9W7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Pdzd7E9Q9W7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Pdzd7E9Q9W7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Pdzd7E9Q9W7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,22■■□□□ 1,95
Pdzd7E9Q9W7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,18■■□□□ 1,94
Pdzd7E9Q9W7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Pdzd7E9Q9W7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Pdzd7E9Q9W7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Pdzd7E9Q9W7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,16■■□□□ 1,94
Pdzd7E9Q9W7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Pdzd7E9Q9W7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Pdzd7E9Q9W7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Pdzd7E9Q9W7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Pdzd7E9Q9W7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Pdzd7E9Q9W7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Pdzd7E9Q9W7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Pdzd7E9Q9W7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Pdzd7E9Q9W7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Pdzd7E9Q9W7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Pdzd7E9Q9W7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Pdzd7E9Q9W7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Pdzd7E9Q9W7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Pdzd7E9Q9W7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Pdzd7E9Q9W7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Pdzd7E9Q9W7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Pdzd7E9Q9W7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,9■■□□□ 1,9
Pdzd7E9Q9W7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Pdzd7E9Q9W7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Pdzd7E9Q9W7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Pdzd7E9Q9W7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Pdzd7E9Q9W7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Pdzd7E9Q9W7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Pdzd7E9Q9W7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Pdzd7E9Q9W7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Pdzd7E9Q9W7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,88
Pdzd7E9Q9W7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26,76■■□□□ 1,87
Pdzd7E9Q9W7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Pdzd7E9Q9W7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26,7■■□□□ 1,87
Pdzd7E9Q9W7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Pdzd7E9Q9W7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Pdzd7E9Q9W7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Pdzd7E9Q9W7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Pdzd7E9Q9W7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Pdzd7E9Q9W7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,63■■□□□ 1,85
Pdzd7E9Q9W7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Pdzd7E9Q9W7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Pdzd7E9Q9W7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Pdzd7E9Q9W7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Pdzd7E9Q9W7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Pdzd7E9Q9W7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,59■■□□□ 1,85
Pdzd7E9Q9W7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Pdzd7E9Q9W7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,59■■□□□ 1,85
Pdzd7E9Q9W7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Pdzd7E9Q9W7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Pdzd7E9Q9W7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Pdzd7E9Q9W7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Pdzd7E9Q9W7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26,49■■□□□ 1,83
Pdzd7E9Q9W7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26,49■■□□□ 1,83
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Pdzd7E9Q9W7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,47■■□□□ 1,83
Pdzd7E9Q9W7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26,46■■□□□ 1,83
Pdzd7E9Q9W7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Pdzd7E9Q9W7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26,43■■□□□ 1,82
Pdzd7E9Q9W7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Pdzd7E9Q9W7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Pdzd7E9Q9W7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
Pdzd7E9Q9W7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26,36■■□□□ 1,81
Pdzd7E9Q9W7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Pdzd7E9Q9W7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Pdzd7E9Q9W7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,2 ms