Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Aldh3b2E9Q3E1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Aldh3b2E9Q3E1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aldh3b2E9Q3E1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Aldh3b2E9Q3E1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Aldh3b2E9Q3E1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Aldh3b2E9Q3E1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Aldh3b2E9Q3E1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Aldh3b2E9Q3E1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Aldh3b2E9Q3E1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Aldh3b2E9Q3E1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Aldh3b2E9Q3E1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Aldh3b2E9Q3E1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aldh3b2E9Q3E1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aldh3b2E9Q3E1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Aldh3b2E9Q3E1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Aldh3b2E9Q3E1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Aldh3b2E9Q3E1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Aldh3b2E9Q3E1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aldh3b2E9Q3E1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Aldh3b2E9Q3E1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Aldh3b2E9Q3E1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Aldh3b2E9Q3E1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Aldh3b2E9Q3E1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Aldh3b2E9Q3E1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aldh3b2E9Q3E1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Aldh3b2E9Q3E1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Aldh3b2E9Q3E1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Aldh3b2E9Q3E1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Aldh3b2E9Q3E1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh3b2E9Q3E1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Aldh3b2E9Q3E1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aldh3b2E9Q3E1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Aldh3b2E9Q3E1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Aldh3b2E9Q3E1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh3b2E9Q3E1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aldh3b2E9Q3E1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aldh3b2E9Q3E1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aldh3b2E9Q3E1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aldh3b2E9Q3E1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh3b2E9Q3E1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aldh3b2E9Q3E1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aldh3b2E9Q3E1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aldh3b2E9Q3E1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aldh3b2E9Q3E1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Aldh3b2E9Q3E1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh3b2E9Q3E1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh3b2E9Q3E1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh3b2E9Q3E1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh3b2E9Q3E1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh3b2E9Q3E1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh3b2E9Q3E1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Aldh3b2E9Q3E1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh3b2E9Q3E1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh3b2E9Q3E1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh3b2E9Q3E1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh3b2E9Q3E1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh3b2E9Q3E1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aldh3b2E9Q3E1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh3b2E9Q3E1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aldh3b2E9Q3E1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Aldh3b2E9Q3E1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh3b2E9Q3E1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Aldh3b2E9Q3E1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh3b2E9Q3E1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh3b2E9Q3E1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Aldh3b2E9Q3E1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Aldh3b2E9Q3E1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Aldh3b2E9Q3E1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Aldh3b2E9Q3E1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Aldh3b2E9Q3E1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh3b2E9Q3E1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Aldh3b2E9Q3E1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh3b2E9Q3E1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh3b2E9Q3E1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh3b2E9Q3E1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Aldh3b2E9Q3E1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Aldh3b2E9Q3E1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Aldh3b2E9Q3E1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh3b2E9Q3E1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Aldh3b2E9Q3E1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh3b2E9Q3E1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Aldh3b2E9Q3E1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh3b2E9Q3E1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh3b2E9Q3E1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aldh3b2E9Q3E1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aldh3b2E9Q3E1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh3b2E9Q3E1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh3b2E9Q3E1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aldh3b2E9Q3E1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aldh3b2E9Q3E1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh3b2E9Q3E1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh3b2E9Q3E1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh3b2E9Q3E1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh3b2E9Q3E1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh3b2E9Q3E1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms