Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Abcc4E9Q236 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34,26■■■■□ 3,07
Abcc4E9Q236 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,25■■■■□ 3,07
Abcc4E9Q236 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,24■■■■□ 3,07
Abcc4E9Q236 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Abcc4E9Q236 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,2■■■■□ 3,07
Abcc4E9Q236 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,18■■■■□ 3,06
Abcc4E9Q236 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Abcc4E9Q236 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC34,17■■■■□ 3,06
Abcc4E9Q236 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,1■■■■□ 3,05
Abcc4E9Q236 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34,07■■■■□ 3,05
Abcc4E9Q236 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Abcc4E9Q236 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,03■■■■□ 3,04
Abcc4E9Q236 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
Abcc4E9Q236 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,97■■■■□ 3,03
Abcc4E9Q236 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33,96■■■■□ 3,03
Abcc4E9Q236 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Abcc4E9Q236 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Abcc4E9Q236 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Abcc4E9Q236 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,94■■■■□ 3,02
Abcc4E9Q236 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Abcc4E9Q236 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,8■■■■□ 3
Abcc4E9Q236 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,79■■■■□ 3
Abcc4E9Q236 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33,76■■■□□ 2,99
Abcc4E9Q236 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,73■■■□□ 2,99
Abcc4E9Q236 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Abcc4E9Q236 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,72■■■□□ 2,99
Abcc4E9Q236 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
Abcc4E9Q236 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,68■■■□□ 2,98
Abcc4E9Q236 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,64■■■□□ 2,98
Abcc4E9Q236 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33,59■■■□□ 2,97
Abcc4E9Q236 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Abcc4E9Q236 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33,57■■■□□ 2,96
Abcc4E9Q236 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33,56■■■□□ 2,96
Abcc4E9Q236 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,54■■■□□ 2,96
Abcc4E9Q236 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33,52■■■□□ 2,96
Abcc4E9Q236 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33,5■■■□□ 2,95
Abcc4E9Q236 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33,44■■■□□ 2,94
Abcc4E9Q236 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33,4■■■□□ 2,94
Abcc4E9Q236 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Abcc4E9Q236 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Abcc4E9Q236 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33,37■■■□□ 2,93
Abcc4E9Q236 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Abcc4E9Q236 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Abcc4E9Q236 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Abcc4E9Q236 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33,31■■■□□ 2,92
Abcc4E9Q236 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Abcc4E9Q236 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Abcc4E9Q236 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Abcc4E9Q236 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Abcc4E9Q236 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33,24■■■□□ 2,91
Abcc4E9Q236 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Abcc4E9Q236 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Abcc4E9Q236 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,21■■■□□ 2,91
Abcc4E9Q236 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,21■■■□□ 2,91
Abcc4E9Q236 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,21■■■□□ 2,91
Abcc4E9Q236 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33,18■■■□□ 2,9
Abcc4E9Q236 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Abcc4E9Q236 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Abcc4E9Q236 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Abcc4E9Q236 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Abcc4E9Q236 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Abcc4E9Q236 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33,1■■■□□ 2,89
Abcc4E9Q236 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Abcc4E9Q236 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Abcc4E9Q236 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33,02■■■□□ 2,88
Abcc4E9Q236 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2,87
Abcc4E9Q236 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Abcc4E9Q236 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Abcc4E9Q236 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Abcc4E9Q236 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Abcc4E9Q236 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32,91■■■□□ 2,86
Abcc4E9Q236 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Abcc4E9Q236 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Abcc4E9Q236 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Abcc4E9Q236 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Abcc4E9Q236 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32,8■■■□□ 2,84
Abcc4E9Q236 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32,74■■■□□ 2,83
Abcc4E9Q236 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32,73■■■□□ 2,83
Abcc4E9Q236 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Abcc4E9Q236 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32,72■■■□□ 2,83
Abcc4E9Q236 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Abcc4E9Q236 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Abcc4E9Q236 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Abcc4E9Q236 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
Abcc4E9Q236 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,64■■■□□ 2,82
Abcc4E9Q236 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Abcc4E9Q236 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,63■■■□□ 2,81
Abcc4E9Q236 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32,61■■■□□ 2,81
Abcc4E9Q236 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Abcc4E9Q236 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Abcc4E9Q236 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC32,57■■■□□ 2,8
Abcc4E9Q236 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Abcc4E9Q236 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
Abcc4E9Q236 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,48■■■□□ 2,79
Abcc4E9Q236 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
Abcc4E9Q236 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32,45■■■□□ 2,78
Abcc4E9Q236 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,42■■■□□ 2,78
Abcc4E9Q236 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC32,42■■■□□ 2,78
Abcc4E9Q236 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,9 ms