Protein–RNA interactions for Protein: E9PYW5

Vmn1r174, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r174E9PYW5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vmn1r174E9PYW5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn1r174E9PYW5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn1r174E9PYW5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn1r174E9PYW5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r174E9PYW5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vmn1r174E9PYW5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vmn1r174E9PYW5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r174E9PYW5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r174E9PYW5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r174E9PYW5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r174E9PYW5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r174E9PYW5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r174E9PYW5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r174E9PYW5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r174E9PYW5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r174E9PYW5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r174E9PYW5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r174E9PYW5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r174E9PYW5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r174E9PYW5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r174E9PYW5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r174E9PYW5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r174E9PYW5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r174E9PYW5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r174E9PYW5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r174E9PYW5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r174E9PYW5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r174E9PYW5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r174E9PYW5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r174E9PYW5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r174E9PYW5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r174E9PYW5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r174E9PYW5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r174E9PYW5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r174E9PYW5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r174E9PYW5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r174E9PYW5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r174E9PYW5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r174E9PYW5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r174E9PYW5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r174E9PYW5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r174E9PYW5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r174E9PYW5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r174E9PYW5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r174E9PYW5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r174E9PYW5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r174E9PYW5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r174E9PYW5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r174E9PYW5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r174E9PYW5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r174E9PYW5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r174E9PYW5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r174E9PYW5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r174E9PYW5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r174E9PYW5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r174E9PYW5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r174E9PYW5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r174E9PYW5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r174E9PYW5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r174E9PYW5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vmn1r174E9PYW5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r174E9PYW5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r174E9PYW5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r174E9PYW5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r174E9PYW5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r174E9PYW5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r174E9PYW5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r174E9PYW5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r174E9PYW5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r174E9PYW5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r174E9PYW5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r174E9PYW5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r174E9PYW5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r174E9PYW5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r174E9PYW5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r174E9PYW5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r174E9PYW5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r174E9PYW5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r174E9PYW5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r174E9PYW5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r174E9PYW5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vmn1r174E9PYW5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r174E9PYW5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vmn1r174E9PYW5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r174E9PYW5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vmn1r174E9PYW5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r174E9PYW5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vmn1r174E9PYW5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmn1r174E9PYW5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r174E9PYW5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vmn1r174E9PYW5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vmn1r174E9PYW5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Vmn1r174E9PYW5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vmn1r174E9PYW5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vmn1r174E9PYW5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r174E9PYW5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vmn1r174E9PYW5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vmn1r174E9PYW5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vmn1r174E9PYW5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms