Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc175E9PVB3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc175E9PVB3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc175E9PVB3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc175E9PVB3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc175E9PVB3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc175E9PVB3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc175E9PVB3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc175E9PVB3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc175E9PVB3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc175E9PVB3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc175E9PVB3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc175E9PVB3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc175E9PVB3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc175E9PVB3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc175E9PVB3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc175E9PVB3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc175E9PVB3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc175E9PVB3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc175E9PVB3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc175E9PVB3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc175E9PVB3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc175E9PVB3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc175E9PVB3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc175E9PVB3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc175E9PVB3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc175E9PVB3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc175E9PVB3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc175E9PVB3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc175E9PVB3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc175E9PVB3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc175E9PVB3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc175E9PVB3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc175E9PVB3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc175E9PVB3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc175E9PVB3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc175E9PVB3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc175E9PVB3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc175E9PVB3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc175E9PVB3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc175E9PVB3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc175E9PVB3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc175E9PVB3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc175E9PVB3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc175E9PVB3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc175E9PVB3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc175E9PVB3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc175E9PVB3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc175E9PVB3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc175E9PVB3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc175E9PVB3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc175E9PVB3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc175E9PVB3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc175E9PVB3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc175E9PVB3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc175E9PVB3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc175E9PVB3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc175E9PVB3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc175E9PVB3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc175E9PVB3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc175E9PVB3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc175E9PVB3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc175E9PVB3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc175E9PVB3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc175E9PVB3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc175E9PVB3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc175E9PVB3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc175E9PVB3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc175E9PVB3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc175E9PVB3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc175E9PVB3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc175E9PVB3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc175E9PVB3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc175E9PVB3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc175E9PVB3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc175E9PVB3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc175E9PVB3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc175E9PVB3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc175E9PVB3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc175E9PVB3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc175E9PVB3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc175E9PVB3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc175E9PVB3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc175E9PVB3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc175E9PVB3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc175E9PVB3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc175E9PVB3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc175E9PVB3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc175E9PVB3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc175E9PVB3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc175E9PVB3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc175E9PVB3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc175E9PVB3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc175E9PVB3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc175E9PVB3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc175E9PVB3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc175E9PVB3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc175E9PVB3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc175E9PVB3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc175E9PVB3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms