Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zfp839E9PUU5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zfp839E9PUU5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Zfp839E9PUU5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zfp839E9PUU5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zfp839E9PUU5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zfp839E9PUU5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zfp839E9PUU5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zfp839E9PUU5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zfp839E9PUU5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zfp839E9PUU5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zfp839E9PUU5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zfp839E9PUU5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zfp839E9PUU5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zfp839E9PUU5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Zfp839E9PUU5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Zfp839E9PUU5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zfp839E9PUU5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zfp839E9PUU5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zfp839E9PUU5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zfp839E9PUU5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zfp839E9PUU5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Zfp839E9PUU5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zfp839E9PUU5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zfp839E9PUU5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zfp839E9PUU5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zfp839E9PUU5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zfp839E9PUU5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zfp839E9PUU5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zfp839E9PUU5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zfp839E9PUU5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zfp839E9PUU5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zfp839E9PUU5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Zfp839E9PUU5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Zfp839E9PUU5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zfp839E9PUU5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zfp839E9PUU5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zfp839E9PUU5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Zfp839E9PUU5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zfp839E9PUU5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zfp839E9PUU5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zfp839E9PUU5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Zfp839E9PUU5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Zfp839E9PUU5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zfp839E9PUU5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zfp839E9PUU5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zfp839E9PUU5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zfp839E9PUU5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Zfp839E9PUU5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zfp839E9PUU5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Zfp839E9PUU5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zfp839E9PUU5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zfp839E9PUU5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zfp839E9PUU5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zfp839E9PUU5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zfp839E9PUU5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zfp839E9PUU5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zfp839E9PUU5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Zfp839E9PUU5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Zfp839E9PUU5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zfp839E9PUU5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Zfp839E9PUU5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Zfp839E9PUU5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zfp839E9PUU5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zfp839E9PUU5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Zfp839E9PUU5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zfp839E9PUU5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zfp839E9PUU5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zfp839E9PUU5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zfp839E9PUU5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zfp839E9PUU5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zfp839E9PUU5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zfp839E9PUU5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Zfp839E9PUU5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zfp839E9PUU5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Zfp839E9PUU5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Zfp839E9PUU5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Zfp839E9PUU5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Zfp839E9PUU5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zfp839E9PUU5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zfp839E9PUU5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zfp839E9PUU5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Zfp839E9PUU5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zfp839E9PUU5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zfp839E9PUU5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Zfp839E9PUU5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zfp839E9PUU5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zfp839E9PUU5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zfp839E9PUU5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zfp839E9PUU5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zfp839E9PUU5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zfp839E9PUU5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfp839E9PUU5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfp839E9PUU5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Zfp839E9PUU5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Zfp839E9PUU5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Zfp839E9PUU5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zfp839E9PUU5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zfp839E9PUU5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Zfp839E9PUU5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms