Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc170D3YXL0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc170D3YXL0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc170D3YXL0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc170D3YXL0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc170D3YXL0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc170D3YXL0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc170D3YXL0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc170D3YXL0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc170D3YXL0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc170D3YXL0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc170D3YXL0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc170D3YXL0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc170D3YXL0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc170D3YXL0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc170D3YXL0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc170D3YXL0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc170D3YXL0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc170D3YXL0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc170D3YXL0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc170D3YXL0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc170D3YXL0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc170D3YXL0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc170D3YXL0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ccdc170D3YXL0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc170D3YXL0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc170D3YXL0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc170D3YXL0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc170D3YXL0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc170D3YXL0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc170D3YXL0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc170D3YXL0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc170D3YXL0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc170D3YXL0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc170D3YXL0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc170D3YXL0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc170D3YXL0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc170D3YXL0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc170D3YXL0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc170D3YXL0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc170D3YXL0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc170D3YXL0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc170D3YXL0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc170D3YXL0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc170D3YXL0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc170D3YXL0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc170D3YXL0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ccdc170D3YXL0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc170D3YXL0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc170D3YXL0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc170D3YXL0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc170D3YXL0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc170D3YXL0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc170D3YXL0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc170D3YXL0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc170D3YXL0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc170D3YXL0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc170D3YXL0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc170D3YXL0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc170D3YXL0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc170D3YXL0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc170D3YXL0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc170D3YXL0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc170D3YXL0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc170D3YXL0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccdc170D3YXL0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc170D3YXL0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc170D3YXL0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc170D3YXL0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc170D3YXL0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc170D3YXL0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc170D3YXL0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc170D3YXL0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc170D3YXL0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc170D3YXL0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc170D3YXL0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc170D3YXL0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc170D3YXL0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc170D3YXL0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc170D3YXL0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc170D3YXL0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc170D3YXL0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc170D3YXL0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc170D3YXL0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc170D3YXL0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc170D3YXL0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc170D3YXL0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc170D3YXL0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc170D3YXL0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc170D3YXL0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc170D3YXL0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc170D3YXL0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc170D3YXL0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc170D3YXL0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc170D3YXL0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc170D3YXL0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc170D3YXL0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc170D3YXL0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms