Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,24■■■□□ 2,43
Samd1D3YXK1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Samd1D3YXK1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Samd1D3YXK1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Samd1D3YXK1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Samd1D3YXK1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Samd1D3YXK1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Samd1D3YXK1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30,15■■■□□ 2,42
Samd1D3YXK1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Samd1D3YXK1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Samd1D3YXK1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Samd1D3YXK1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,09■■■□□ 2,41
Samd1D3YXK1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Samd1D3YXK1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Samd1D3YXK1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Samd1D3YXK1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Samd1D3YXK1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,4
Samd1D3YXK1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Samd1D3YXK1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Samd1D3YXK1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Samd1D3YXK1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,96■■■□□ 2,39
Samd1D3YXK1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Samd1D3YXK1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29,94■■■□□ 2,38
Samd1D3YXK1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Samd1D3YXK1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Samd1D3YXK1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Samd1D3YXK1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Samd1D3YXK1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Samd1D3YXK1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Samd1D3YXK1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Samd1D3YXK1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Samd1D3YXK1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,79■■■□□ 2,36
Samd1D3YXK1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Samd1D3YXK1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Samd1D3YXK1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Samd1D3YXK1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,72■■■□□ 2,35
Samd1D3YXK1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29,66■■■□□ 2,34
Samd1D3YXK1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Samd1D3YXK1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Samd1D3YXK1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Samd1D3YXK1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Samd1D3YXK1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Samd1D3YXK1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Samd1D3YXK1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29,57■■■□□ 2,32
Samd1D3YXK1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Samd1D3YXK1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Samd1D3YXK1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Samd1D3YXK1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Samd1D3YXK1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29,48■■■□□ 2,31
Samd1D3YXK1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29,45■■■□□ 2,31
Samd1D3YXK1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Samd1D3YXK1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Samd1D3YXK1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Samd1D3YXK1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29,4■■■□□ 2,3
Samd1D3YXK1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Samd1D3YXK1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Samd1D3YXK1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Samd1D3YXK1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Samd1D3YXK1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Samd1D3YXK1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Samd1D3YXK1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Samd1D3YXK1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Samd1D3YXK1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Samd1D3YXK1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Samd1D3YXK1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Samd1D3YXK1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Samd1D3YXK1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Samd1D3YXK1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Samd1D3YXK1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29,24■■■□□ 2,27
Samd1D3YXK1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,2■■■□□ 2,26
Samd1D3YXK1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Samd1D3YXK1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Samd1D3YXK1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,14■■■□□ 2,26
Samd1D3YXK1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,13■■■□□ 2,25
Samd1D3YXK1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Samd1D3YXK1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Samd1D3YXK1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Samd1D3YXK1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,04■■■□□ 2,24
Samd1D3YXK1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Samd1D3YXK1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Samd1D3YXK1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Samd1D3YXK1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Samd1D3YXK1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Samd1D3YXK1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Samd1D3YXK1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Samd1D3YXK1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Samd1D3YXK1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Samd1D3YXK1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,9■■■□□ 2,22
Samd1D3YXK1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Samd1D3YXK1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Samd1D3YXK1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Samd1D3YXK1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Samd1D3YXK1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28,79■■■□□ 2,2
Samd1D3YXK1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Samd1D3YXK1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Samd1D3YXK1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Samd1D3YXK1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Samd1D3YXK1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Samd1D3YXK1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Samd1D3YXK1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms