Protein–RNA interactions for Protein: D3YVL2

Cfap70, Cilia and flagella-associated protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap70D3YVL2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35,1■■■■□ 3,21
Cfap70D3YVL2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Cfap70D3YVL2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,08■■■■□ 3,21
Cfap70D3YVL2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
Cfap70D3YVL2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Cfap70D3YVL2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Cfap70D3YVL2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
Cfap70D3YVL2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Cfap70D3YVL2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Cfap70D3YVL2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,88■■■■□ 3,17
Cfap70D3YVL2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,87■■■■□ 3,17
Cfap70D3YVL2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,85■■■■□ 3,17
Cfap70D3YVL2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Cfap70D3YVL2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34,83■■■■□ 3,17
Cfap70D3YVL2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34,83■■■■□ 3,17
Cfap70D3YVL2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,81■■■■□ 3,16
Cfap70D3YVL2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34,78■■■■□ 3,16
Cfap70D3YVL2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,77■■■■□ 3,16
Cfap70D3YVL2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,76■■■■□ 3,16
Cfap70D3YVL2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34,76■■■■□ 3,16
Cfap70D3YVL2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34,7■■■■□ 3,15
Cfap70D3YVL2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34,69■■■■□ 3,14
Cfap70D3YVL2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34,67■■■■□ 3,14
Cfap70D3YVL2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,66■■■■□ 3,14
Cfap70D3YVL2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,63■■■■□ 3,13
Cfap70D3YVL2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Cfap70D3YVL2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,61■■■■□ 3,13
Cfap70D3YVL2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34,58■■■■□ 3,13
Cfap70D3YVL2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34,58■■■■□ 3,13
Cfap70D3YVL2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34,55■■■■□ 3,12
Cfap70D3YVL2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Cfap70D3YVL2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34,48■■■■□ 3,11
Cfap70D3YVL2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Cfap70D3YVL2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34,46■■■■□ 3,11
Cfap70D3YVL2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,4■■■■□ 3,1
Cfap70D3YVL2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Cfap70D3YVL2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
Cfap70D3YVL2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,29■■■■□ 3,08
Cfap70D3YVL2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34,27■■■■□ 3,08
Cfap70D3YVL2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,23■■■■□ 3,07
Cfap70D3YVL2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,21■■■■□ 3,07
Cfap70D3YVL2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34,2■■■■□ 3,06
Cfap70D3YVL2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34,18■■■■□ 3,06
Cfap70D3YVL2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Cfap70D3YVL2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC34,17■■■■□ 3,06
Cfap70D3YVL2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34,14■■■■□ 3,06
Cfap70D3YVL2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34,1■■■■□ 3,05
Cfap70D3YVL2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34,1■■■■□ 3,05
Cfap70D3YVL2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34,09■■■■□ 3,05
Cfap70D3YVL2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34,09■■■■□ 3,05
Cfap70D3YVL2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34,08■■■■□ 3,05
Cfap70D3YVL2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC34,07■■■■□ 3,04
Cfap70D3YVL2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Cfap70D3YVL2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
Cfap70D3YVL2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC33,98■■■■□ 3,03
Cfap70D3YVL2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
Cfap70D3YVL2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,95■■■■□ 3,02
Cfap70D3YVL2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Cfap70D3YVL2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33,93■■■■□ 3,02
Cfap70D3YVL2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Cfap70D3YVL2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Cfap70D3YVL2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Cfap70D3YVL2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Cfap70D3YVL2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Cfap70D3YVL2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
Cfap70D3YVL2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
Cfap70D3YVL2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Cfap70D3YVL2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,81■■■■□ 3
Cfap70D3YVL2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,81■■■■□ 3
Cfap70D3YVL2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33,79■■■■□ 3
Cfap70D3YVL2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Cfap70D3YVL2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,76■■■■□ 3
Cfap70D3YVL2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33,74■■■□□ 2,99
Cfap70D3YVL2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
Cfap70D3YVL2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33,69■■■□□ 2,98
Cfap70D3YVL2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,68■■■□□ 2,98
Cfap70D3YVL2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33,68■■■□□ 2,98
Cfap70D3YVL2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Cfap70D3YVL2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,63■■■□□ 2,97
Cfap70D3YVL2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33,63■■■□□ 2,97
Cfap70D3YVL2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,62■■■□□ 2,97
Cfap70D3YVL2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33,62■■■□□ 2,97
Cfap70D3YVL2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33,61■■■□□ 2,97
Cfap70D3YVL2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Cfap70D3YVL2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
Cfap70D3YVL2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33,59■■■□□ 2,97
Cfap70D3YVL2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
Cfap70D3YVL2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33,54■■■□□ 2,96
Cfap70D3YVL2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
Cfap70D3YVL2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Cfap70D3YVL2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Cfap70D3YVL2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC33,49■■■□□ 2,95
Cfap70D3YVL2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
Cfap70D3YVL2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Cfap70D3YVL2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Cfap70D3YVL2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33,45■■■□□ 2,95
Cfap70D3YVL2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
Cfap70D3YVL2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
Cfap70D3YVL2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Cfap70D3YVL2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,35■■■□□ 2,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms