Protein–RNA interactions for Protein: B8JK39

Itga9, Integrin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga9B8JK39 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,01■■■□□ 2,07
Itga9B8JK39 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Itga9B8JK39 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2,07
Itga9B8JK39 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Itga9B8JK39 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Itga9B8JK39 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Itga9B8JK39 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,93■■■□□ 2,06
Itga9B8JK39 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Itga9B8JK39 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Itga9B8JK39 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Itga9B8JK39 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,05
Itga9B8JK39 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Itga9B8JK39 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Itga9B8JK39 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Itga9B8JK39 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,04
Itga9B8JK39 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Itga9B8JK39 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Itga9B8JK39 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Itga9B8JK39 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Itga9B8JK39 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Itga9B8JK39 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Itga9B8JK39 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Itga9B8JK39 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Itga9B8JK39 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,66■■■□□ 2,02
Itga9B8JK39 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Itga9B8JK39 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Itga9B8JK39 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27,63■■■□□ 2,01
Itga9B8JK39 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Itga9B8JK39 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,58■■■□□ 2,01
Itga9B8JK39 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Itga9B8JK39 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Itga9B8JK39 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,55■■■□□ 2
Itga9B8JK39 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■■□□ 2
Itga9B8JK39 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Itga9B8JK39 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,48■■□□□ 1,99
Itga9B8JK39 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Itga9B8JK39 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Itga9B8JK39 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Itga9B8JK39 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,44■■□□□ 1,98
Itga9B8JK39 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Itga9B8JK39 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Itga9B8JK39 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Itga9B8JK39 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27,39■■□□□ 1,97
Itga9B8JK39 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Itga9B8JK39 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Itga9B8JK39 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,35■■□□□ 1,97
Itga9B8JK39 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Itga9B8JK39 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Itga9B8JK39 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Itga9B8JK39 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Itga9B8JK39 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Itga9B8JK39 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Itga9B8JK39 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Itga9B8JK39 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Itga9B8JK39 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Itga9B8JK39 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Itga9B8JK39 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27,17■■□□□ 1,94
Itga9B8JK39 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Itga9B8JK39 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Itga9B8JK39 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Itga9B8JK39 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Itga9B8JK39 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Itga9B8JK39 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,09■■□□□ 1,93
Itga9B8JK39 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Itga9B8JK39 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Itga9B8JK39 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Itga9B8JK39 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Itga9B8JK39 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Itga9B8JK39 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Itga9B8JK39 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Itga9B8JK39 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Itga9B8JK39 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Itga9B8JK39 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Itga9B8JK39 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Itga9B8JK39 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Itga9B8JK39 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26,86■■□□□ 1,89
Itga9B8JK39 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Itga9B8JK39 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Itga9B8JK39 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Itga9B8JK39 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Itga9B8JK39 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26,83■■□□□ 1,89
Itga9B8JK39 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Itga9B8JK39 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Itga9B8JK39 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Itga9B8JK39 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Itga9B8JK39 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26,78■■□□□ 1,88
Itga9B8JK39 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Itga9B8JK39 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Itga9B8JK39 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,88
Itga9B8JK39 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,88
Itga9B8JK39 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Itga9B8JK39 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26,75■■□□□ 1,87
Itga9B8JK39 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Itga9B8JK39 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Itga9B8JK39 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Itga9B8JK39 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Itga9B8JK39 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Itga9B8JK39 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,66■■□□□ 1,86
Itga9B8JK39 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Itga9B8JK39 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42,5 ms