Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rd3lB2RV38 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rd3lB2RV38 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rd3lB2RV38 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rd3lB2RV38 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rd3lB2RV38 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rd3lB2RV38 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rd3lB2RV38 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rd3lB2RV38 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rd3lB2RV38 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rd3lB2RV38 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rd3lB2RV38 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rd3lB2RV38 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rd3lB2RV38 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rd3lB2RV38 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rd3lB2RV38 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rd3lB2RV38 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rd3lB2RV38 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rd3lB2RV38 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rd3lB2RV38 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rd3lB2RV38 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rd3lB2RV38 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rd3lB2RV38 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rd3lB2RV38 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rd3lB2RV38 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rd3lB2RV38 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rd3lB2RV38 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rd3lB2RV38 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rd3lB2RV38 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rd3lB2RV38 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rd3lB2RV38 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rd3lB2RV38 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rd3lB2RV38 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rd3lB2RV38 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rd3lB2RV38 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rd3lB2RV38 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rd3lB2RV38 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rd3lB2RV38 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rd3lB2RV38 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rd3lB2RV38 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rd3lB2RV38 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rd3lB2RV38 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rd3lB2RV38 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rd3lB2RV38 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rd3lB2RV38 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rd3lB2RV38 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rd3lB2RV38 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rd3lB2RV38 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rd3lB2RV38 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rd3lB2RV38 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rd3lB2RV38 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rd3lB2RV38 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rd3lB2RV38 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rd3lB2RV38 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rd3lB2RV38 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rd3lB2RV38 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rd3lB2RV38 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rd3lB2RV38 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rd3lB2RV38 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rd3lB2RV38 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rd3lB2RV38 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rd3lB2RV38 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rd3lB2RV38 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rd3lB2RV38 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rd3lB2RV38 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rd3lB2RV38 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rd3lB2RV38 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rd3lB2RV38 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rd3lB2RV38 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rd3lB2RV38 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rd3lB2RV38 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rd3lB2RV38 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rd3lB2RV38 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rd3lB2RV38 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rd3lB2RV38 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rd3lB2RV38 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rd3lB2RV38 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rd3lB2RV38 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rd3lB2RV38 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rd3lB2RV38 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rd3lB2RV38 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rd3lB2RV38 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rd3lB2RV38 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rd3lB2RV38 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rd3lB2RV38 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rd3lB2RV38 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rd3lB2RV38 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rd3lB2RV38 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rd3lB2RV38 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rd3lB2RV38 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rd3lB2RV38 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rd3lB2RV38 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rd3lB2RV38 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rd3lB2RV38 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rd3lB2RV38 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rd3lB2RV38 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rd3lB2RV38 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rd3lB2RV38 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rd3lB2RV38 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rd3lB2RV38 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms