Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Zfc3h1B2RT41 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zfc3h1B2RT41 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zfc3h1B2RT41 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zfc3h1B2RT41 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zfc3h1B2RT41 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zfc3h1B2RT41 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zfc3h1B2RT41 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Zfc3h1B2RT41 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Zfc3h1B2RT41 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Zfc3h1B2RT41 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Zfc3h1B2RT41 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zfc3h1B2RT41 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Zfc3h1B2RT41 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Zfc3h1B2RT41 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Zfc3h1B2RT41 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zfc3h1B2RT41 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Zfc3h1B2RT41 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Zfc3h1B2RT41 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Zfc3h1B2RT41 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zfc3h1B2RT41 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zfc3h1B2RT41 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zfc3h1B2RT41 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zfc3h1B2RT41 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Zfc3h1B2RT41 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Zfc3h1B2RT41 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zfc3h1B2RT41 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Zfc3h1B2RT41 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Zfc3h1B2RT41 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zfc3h1B2RT41 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Zfc3h1B2RT41 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Zfc3h1B2RT41 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Zfc3h1B2RT41 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Zfc3h1B2RT41 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Zfc3h1B2RT41 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Zfc3h1B2RT41 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zfc3h1B2RT41 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Zfc3h1B2RT41 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Zfc3h1B2RT41 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Zfc3h1B2RT41 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zfc3h1B2RT41 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Zfc3h1B2RT41 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Zfc3h1B2RT41 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Zfc3h1B2RT41 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Zfc3h1B2RT41 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Zfc3h1B2RT41 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zfc3h1B2RT41 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Zfc3h1B2RT41 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Zfc3h1B2RT41 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zfc3h1B2RT41 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Zfc3h1B2RT41 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Zfc3h1B2RT41 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Zfc3h1B2RT41 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zfc3h1B2RT41 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Zfc3h1B2RT41 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Zfc3h1B2RT41 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Zfc3h1B2RT41 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Zfc3h1B2RT41 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Zfc3h1B2RT41 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Zfc3h1B2RT41 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Zfc3h1B2RT41 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zfc3h1B2RT41 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zfc3h1B2RT41 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zfc3h1B2RT41 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Zfc3h1B2RT41 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Zfc3h1B2RT41 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Zfc3h1B2RT41 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27■■□□□ 1.91
Zfc3h1B2RT41 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Zfc3h1B2RT41 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zfc3h1B2RT41 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Zfc3h1B2RT41 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zfc3h1B2RT41 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Zfc3h1B2RT41 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zfc3h1B2RT41 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zfc3h1B2RT41 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zfc3h1B2RT41 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zfc3h1B2RT41 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zfc3h1B2RT41 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zfc3h1B2RT41 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zfc3h1B2RT41 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Zfc3h1B2RT41 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zfc3h1B2RT41 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Zfc3h1B2RT41 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zfc3h1B2RT41 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zfc3h1B2RT41 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Zfc3h1B2RT41 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Zfc3h1B2RT41 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zfc3h1B2RT41 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zfc3h1B2RT41 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zfc3h1B2RT41 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zfc3h1B2RT41 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zfc3h1B2RT41 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zfc3h1B2RT41 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Zfc3h1B2RT41 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zfc3h1B2RT41 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zfc3h1B2RT41 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zfc3h1B2RT41 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zfc3h1B2RT41 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Zfc3h1B2RT41 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Zfc3h1B2RT41 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms